ChIP-seq service
Chromatinová imunoprecipitace (ChIP), klasická experimentální metoda pro studium interakce mezi proteinem a DNA, je široce využívána v souvisejících oblastech, jako je modifikace histonů a genová exprese regulovaná specifickými transkripčními faktory. S rozvojem a vyspělostí technologie NGS umožňuje sekvenování ChIP (ChIP-seq), které představuje integraci chromatinových imunoprecipitačních experimentů s vysokokapacitním sekvenováním, efektivní a přesný screening vazebných míst pro proteiny v celém genomu. Navíc lze porovnávat vazebná místa DNA spojená se specializovanými proteiny v různých typech buněk a tkání díky tomu, že živé buňky mají původ v komplexech protein-DNA.
Úvod do sekvenování ChIP
ChIP-seq, stejně jako RNA-seq, zní tajemně a složitě, ale není tomu tak. Zde je jemný úvod do této problematiky, který se zabývá základy tohoto experimentu, způsobem zpracování dat a druhy věcí, které s nimi můžete dělat.
Průvodce vzorkem
| Služba | Typ vzorku | Minimální množství | Minimální koncentrace | Kvalita |
|---|---|---|---|---|
| ChIP-.seq | DNA | 10ng | 1 ng/µl | Fragmentovaná na 100-300bp |
*Důrazně se doporučuje měření koncentrace pomocí Qubitu.
*Prosím, poskytněte výsledky Bioanalyzeru pro váš vzorek, pokud jsou k dispozici.
*Prosím, poskytněte DNA získanou ChIP ve vodě bez nukleáz. Pokud bude při spuštění čipu DNA v našem přístroji Bioanalyzer 2100 zjištěna jakákoli RNáza, budou účtovány náklady na vyčištění kontaminace způsobené RNázou.
Pracovní postup služby
Analytická pipeline (pro všeobecné účely)
.