Jedním z nejúčinnějších způsobů, jak zvládnout Cladosporiovou hnilobu klasů, je co nejdříve zjistit její výskyt a upravit prostředí, ve kterém se kukuřice pěstuje a skladuje. Průzkum polí na přítomnost hniloby klasů, který by se měl provádět každé dva týdny, a testování na kontaminaci mykotoxiny je prvním krokem k posouzení, zda je či není přítomna hniloba klasů obecně, ačkoli žádný mykotoxin není spojen konkrétně s C. herbarum. Problematická pole lze charakterizovat tím, že více než 10 % klasů obsahuje houbu na 10-20 % zrna. Infikované klasy by měly být co nejdříve sklizeny, vyčištěny, aby se odstranily částečky houby, okamžitě vysušeny na vlhkost 15 % nebo nižší, aby se zastavil růst houby, a uskladněny ve vzdušném prostředí při vlhkosti 13-14 % mezi 35 a 40 °C, aby se zastavilo nepohlavní rozmnožování a šíření houby. Tato kultivační opatření mohou výrazně snížit ztráty na výnosech.
C. herbarum potřebuje k infikování svého hostitele otvor, takže kultivační opatření, která zabrání poranění jader, by zabránila infekci nových rostlin. Insekticidy mohou být včas použity k chemické regulaci zavíječe kukuřičného a zavíječe kukuřičného, kteří poškozují jádra a umožňují tak vniknutí inokula dovnitř. Také kombajny by měly být dezinfikovány a správně seřízeny, aby se minimalizovalo poškození zrn během sklizně.
Dalším méně účinným způsobem, jak řídit, jaké procento úrody je infikováno, je výsadba rezistentních odrůd a vyřazení těch nejnáchylnějších. Je však třeba zmínit, že žádný hybrid není odolný vůči všem hnilobným houbám klasu a odolné odrůdy nejsou široce dostupné, takže i když může být odrůda odolná vůči hnilobě klasu Cladosporium, může být ohrožena infekcí jinou hnilobnou houbou klasu. Větší pokrytí slupky a silnější obal semen také ztěžují prvotní infikování hostitele. Střídání plodin by pravděpodobně bylo účinnou kulturní kontrolní metodou k eliminaci patogenu, ale aby došlo k významnému ovlivnění úrovně inokula, museli by ji dodržovat všichni pěstitelé kukuřice v daném okrese. Pokud by všichni pěstitelé kukuřice nedodržovali střídání plodin, spory z okolních polí by se jednoduše přenesly větrem na jiná pole a zabránily by poklesu hladiny inokula na rozumnou úroveň.
.