Střevní žlázy v tlustém střevě jsou často označovány jako tlusté střevo krypty. Vnitřní povrch epitelu tlustého střeva je přerušován invaginacemi, tzv. colon crypts. Krypty tlustého střeva mají tvar mikroskopických tlustostěnných zkumavek s centrálním otvorem po celé délce zkumavky (lumen krypty). Zde jsou zobrazeny čtyři řezy tkání, dva (A a B) řezané napříč dlouhými osami krypt a dva (C a D) řezané rovnoběžně s dlouhými osami.
Na těchto snímcích byly buňky obarveny tak, aby se ukázala hnědooranžová barva, pokud buňky produkují mitochondriální protein zvaný cytochrom c oxidáza podjednotka I (CCOI nebo COX-1). Jádra buněk (nacházející se na vnějších okrajích buněk lemujících stěny krypt) jsou obarvena modrošedě hematoxylinem. Jak je vidět na panelech C a D, krypty jsou dlouhé přibližně 75 až 110 buněk. Průměrný obvod krypty je 23 buněk. Ze snímků je patrné, že na jednu kryptu tlustého střeva připadá v průměru asi 1725 až 2530 buněk. Dalším měřením bylo dosaženo rozmezí 1500 až 4900 buněk na jednu kryptu tlustého střeva. Buňky vznikají na bázi krypty a migrují vzhůru podél osy krypty, než jsou po několika dnech vypuštěny do lumen tlustého střeva. Na bázích krypt se nachází 5 až 6 kmenových buněk.
Podle odhadu na obrázku v panelu A připadá na čtvereční milimetr epitelu tlustého střeva přibližně 100 krypt. Délka lidského tlustého střeva je v průměru 160,5 cm (měřeno od dna céka ke kolorektálnímu spojení) s rozmezím od 80 cm do 313 cm. Průměrný vnitřní obvod tlustého střeva je 6,2 cm. Vnitřní povrchová epitelová plocha lidského tlustého střeva má tedy v průměru rozlohu asi 995 cm2, což zahrnuje 9 950 000 (téměř 10 milionů) krypt.
Na čtyřech zobrazených řezech tkání má mnoho střevních žláz buňky s mutací mitochondriální DNA v genu CCOI a jeví se většinou bílé, přičemž jejich hlavní barvou je modrošedé zbarvení jader. Jak je vidět na panelu B, zdá se, že část kmenových buněk tří krypt má mutaci v CCOI, takže 40 % až 50 % buněk vznikajících z těchto kmenových buněk tvoří bílý segment v oblasti příčného řezu.
Obecně je procento krypt s nedostatkem CCOI před 40. rokem života menší než 1 %, ale pak se lineárně zvyšuje s věkem. Krypty tlustého střeva s nedostatkem CCOI dosahují ve věku 80-84 let v průměru 18 % u žen a 23 % u mužů.
Krypty tlustého střeva se mohou rozmnožovat dělením, jak je vidět na panelu C, kde se krypta dělí a vytváří dvě krypty, a na panelu B, kde se zdá, že alespoň jedna krypta se dělí. Většina krypt s nedostatkem CCOI se nachází ve shlucích krypt (klonech krypt) se dvěma nebo více kryptami s nedostatkem CCOI, které spolu sousedí (viz panel D)
.