For dem, der undrede sig, gik det fint med mine kobberreaktioner forleden dag. De startede med at være smukt blå (kobberjodid og en aminosyre i ren DMSO – hvis det ikke er blåt, bliver det måske grønt, og hvis det ikke er hverken det ene eller det andet, har man gjort noget forkert). Selvfølgelig bliver farven ikke ved med at være. Kobberet ender som en del af et lilla-brunt slam, der skal filtreres ud af blandingen, hvilket er den største ulempe ved disse Ullman-reaktioner, uanset hvordan folk forsøger at skrubbe dem op for høfligt selskab.
Og DMSO er den anden ulempe, fordi man skal vaske det stads ud med en masse vand. Det er et af de opløsningsmidler i laboratoriet, som alle har hørt om, selv om de har sovet i kemi på gymnasiet. Men det er ikke et, som vi bruger særlig meget til reaktioner, fordi det er noget af et besvær. Det opløser det meste, hvilket er en god egenskab, men sammen med denne egenskab kommer evnen til at forurene det meste. Hvis dit produkt er ret fedtet og upolært, kan du dele reaktionen op mellem vand og et mere organisk opløsningsmiddel (æter er det, jeg brugte denne gang) og vaske det meget rundt. Men hvis dit produkt er virkelig polært, kan du få en lang eftermiddag.
Den mægtige opløsning er noget, du skal passe på, hvis du spilder det på dig selv, selvfølgelig. DMSO er berømt for at trænge ind i huden (nej, jeg aner ikke, om det gør noget ved gigt). Og selv om mange af mine forbindelser ikke er særlig fysiologisk aktive, vil jeg helst ikke dosere mig selv med dem for at tjekke disse tal. I den yderste ende af skalaen er en opløsning af cyanid i DMSO potentielt meget farligt stof. Jeg har lavet cyanidreaktioner som denne mange gange, men altid mens jeg var opmærksom på opgaven.
Det sted, hvor DMSO virkelig bliver brugt, er i forbindelseslageret. Den egenskab, at den opløser alting, er praktisk, når man har et par hundrede tusinde forbindelser at håndtere. Standardmetoden har i nogle år været at opbevare forbindelser i fryseren i en eller anden defineret koncentration i DMSO – opløsningsmidlet fryser let, ned omkring hvor vand gør det (Ikke så! Faktisk har jeg set i fryse i et køligt laboratorium et par gange, nu hvor jeg bliver mindet om det i kommentarerne til dette indlæg. Ren DMSO størkner omkring 17 til 19 C, hvilket svarer til ca. 64 F C – dog lidt lavere med de screeningsforbindelser, der er opløst i det).
Men der er problemer. For det første er DMSO ikke inert. Det er en anden grund til, at det ikke bliver brugt så meget som opløsningsmiddel i laboratoriet; der er mange reaktionsbetingelser, under hvilke det ikke ville kunne modstå at deltage i festen. Man kan oxidere ting ved at lade dem ligge i DMSO åbent for luft, hvilket man ikke ønsker at gøre ved indsamlingen af screeningsforbindelser, så folk der gør så meget håndtering under nitrogen som muligt. Forbindelser, der ligger skødesløst i DMSO, har en tendens til at blive gule, hvilket er på vej til rødt, hvilket er på vej til brunt, og der findes ingen rene brune vidundermidler.
Et andet problem er den kærlighed til vand. Åbne DMSO-beholdere trækker vand ind lige ud af luften, og et par uforsigtige fryse/opblødningscyklusser med en screeningsskive vil ikke blot blæse dine omhyggeligt udarbejdede koncentrationer op, det kan meget vel også begynde at smadre dine forbindelser ud af opløsningen. De mindre polære stoffer vil begynde at beslutte, at ren DMSO er én ting, men 50/50 DMSO/vand er noget helt andet. Så du skal ikke kun arbejde under nitrogen, hvis du kan, men også under tør nitrogen, og du skal sørge for, at pladerne er godt forseglet, mens de ligger i fryseren (som et alternativ kan du gå videre og putte vand i fra starten og tage konsekvenserne). Alle disse bekymringer begynder at slide på fordelene ved DMSO som universalopløsningsmiddel, men ikke helt nok til at afholde folk fra at bruge det.
Og hvad med de forbindelser, der ikke opløses i stoffet? Tja, det er et ret sikkert bud, at et lille molekyle, der ikke kan opløses i DMSO, vil have meget svært ved at blive et lægemiddel, og det er også et meget uattraktivt spor at starte fra. Det er den slags molekyle, der ville have en tendens til bare at gå lige igennem fordøjelseskanalen uden at bemærke, at der er ting, der forsøger at få det i opløsning. Og hvad angår noget, der gives i.v., hvis man ikke kan få det til at gå over i ren DMSO, hvad er så chancerne for at få det over i en slags saltvandsinjektionsopløsning? Eller chancerne for, at det ikke vil styrte ud i venen og give en øjeblikkelig emboli? Nej, zonen med små organiske stoffer, der ikke er opløselige i DMSO, er ikke et godt sted at gå på jagt. Vi lader proteiner være ude af det, men hvis nogen kender et lille molekylært lægemiddel, der ikke kan gå i DMSO, vil jeg gerne høre om det. Taxol, måske?