Teksten i “Mother” omhandler begge Lennons forældre, som begge forlod ham i hans barndom. Hans far, Alf, forlod familien, da John var et spædbarn. Hans mor, Julia, boede ikke sammen med sin søn, selv om de havde et godt forhold; hun blev ramt og dræbt i en bilulykke den 15. juli 1958 af en politimand uden for tjeneste ved navn Eric Clague, da Lennon var 17 år. Under en af sine sidste koncerter udtalte Lennon, at sangen ikke kun handlede om hans forældre, men snarere “om 99 % af forældrene, levende eller halvdøde”.
“Mother” åbner albummet og starter med en begravelsesklokke, der langsomt ringer fire gange. Sangen slutter med, at Lennon gentager sætningen “Mama don’t go, daddy come home”, hver gang med stigende intensitet, indtil han skriger replikken, mens sangen fader ud.
Lennon blev inspireret til at skrive sangen efter at have gennemgået primal terapi med Arthur Janov, først i hans hjem i Tittenhurst Park og derefter på Primal Institute i Californien, hvor han blev i fire måneder. Lennon, der til sidst hånede Janov, beskrev oprindeligt terapien som “noget, der var vigtigere for mig end The Beatles”.
Men selv om Lennon sagde, at “Mother” var den sang, der “syntes at fænge i mit hoved”, var han i tvivl om dens kommercielle appel, og han overvejede at udgive “Love” som en single i stedet. I november 1982 blev en remixet version af “Love” udgivet som single for at hjælpe med at promovere LP’en The John Lennon Collection.
En tidlig version af “Mother”, som Lennon spillede på elguitar, kan høres på John Lennon Anthology-boxen.
En demoversion af sangen blev vist i den sidste scene og i rulleteksterne i den biografiske John Lennon-film Nowhere Boy fra 2009.