Tarmkirtlerne i tyktarmen omtales ofte som colonkrypter. Den epitheliale indvendige overflade af colon er punkteret af invaginationer, colonkrypterne. Colonkrypterne er formet som mikroskopiske tykvæggede reagensglas med et centralt hul i rørets længde (kryptelumenet). Her er vist fire vævssnit, to (A og B) skåret på tværs af kryptens længdeakse og to (C og D) skåret parallelt med længdeakserne.
På disse billeder er cellerne blevet farvet for at vise en brun-orange farve, hvis cellerne producerer et mitokondrieprotein kaldet cytokrom c oxidase subunit I (CCOI eller COX-1). Cellernes kerner (som er placeret i de ydre kanter af cellerne, der beklæder kryptens vægge) er farvet blågrå med hæmatoxylin. Som det ses i panel C og D, er krypterne ca. 75 til ca. 110 celler lange. Den gennemsnitlige omkreds af krypterne er 23 celler. Af billederne fremgår det, at der i gennemsnit er ca. 1 725 til 2530 celler pr. kolonkrypt. Et andet mål blev opnået, som giver et interval på 1.500 til 4.900 celler pr. kolonkrypt. Cellerne produceres ved kryptobasen og vandrer opad langs kryptoaksen, inden de dage senere smides ud i koloniens lumen. Der er 5 til 6 stamceller ved kryptens basis.
Som skønnet ud fra billedet i panel A er der ca. 100 kolonkrypter pr. kvadratmillimeter af kolonepitelet. Længden af den menneskelige tyktarm er i gennemsnit 160,5 cm (målt fra bunden af cecum til den colorectale overgang) med et interval på 80 cm til 313 cm. Den gennemsnitlige indre omkreds af tyktarmen er 6,2 cm. Det indre overfladeepitelområde i den menneskelige tyktarm har således et areal på gennemsnitligt ca. 995 cm2 , hvilket omfatter 9.950.000 (tæt på 10 millioner) krypter.
I de fire vævssnit, der er vist her, har mange af tarmkirtlerne celler med en mitokondrie-DNA-mutation i CCOI-genet og fremstår for det meste hvide, hvor deres vigtigste farve er den blågrå farvning af kerner. Som det ses i panel B, synes en del af stamcellerne i tre krypter at have en mutation i CCOI, således at 40-50 % af de celler, der udspringer af disse stamceller, danner et hvidt segment i tværsnitområdet.
Samlet set er procentdelen af krypter med mangel på CCOI mindre end 1 % før 40-års alderen, men stiger derefter lineært med alderen. Colon-krypterne med mangel på CCOI når i gennemsnit op på 18 % hos kvinder og 23 % hos mænd ved 80-84 års alderen.
Krypterne i colon kan reproducere sig ved spaltning, som det ses i panel C, hvor en krypt deler sig og danner to krypter, og i panel B, hvor mindst én krypt synes at være ved at spalte sig. De fleste krypter med mangel på CCOI er i klynger af krypter (kloner af krypter) med to eller flere krypter med mangel på CCOI ved siden af hinanden (se panel D).