Das CD40LG-Gen liefert Anweisungen für die Herstellung eines Proteins namens CD40-Ligand, das sich auf der Oberfläche von Zellen des Immunsystems, den so genannten T-Zellen, befindet. Der CD40-Ligand haftet wie ein Schlüssel im Schloss an seinem Rezeptorprotein CD40, das sich auf der Oberfläche von Zellen des Immunsystems, den so genannten B-Zellen, befindet. B-Zellen sind an der Produktion von Proteinen beteiligt, die Antikörper oder Immunglobuline genannt werden und den Körper vor Infektionen schützen. Es gibt mehrere Klassen von Antikörpern, und jede hat eine andere Funktion im Immunsystem. B-Zellen sind in der Lage, ohne Signale von anderen Zellen zu Zellen zu reifen, die Immunglobulin M (IgM) produzieren. Damit B-Zellen zu Zellen heranreifen können, die Antikörper einer anderen Klasse produzieren, muss der CD40-Rezeptor mit dem CD40-Liganden interagieren. Wenn diese beiden Proteine miteinander verbunden sind, lösen sie eine Reihe chemischer Signale aus, die die B-Zelle anweisen, mit der Produktion von Immunglobulin G (IgG), Immunglobulin A (IgA) und Immunglobulin E (IgE) zu beginnen.
CD40-Ligand ist auch notwendig, damit T-Zellen mit anderen Zellen des Immunsystems interagieren können, und er spielt eine Schlüsselrolle bei der T-Zell-Differenzierung (dem Prozess, bei dem Zellen reifen, um bestimmte Funktionen auszuführen).