Abgesehen von der Reizung bewegen sich die Fliegen jedoch häufig von Wirt zu Wirt und vom Anus zum Gesicht oder zu offenen Läsionen; dementsprechend können sie gefährliche Träger für viele infektiöse Organismen sein. Zu den bakteriellen Beispielen, insbesondere in der Karibik und in Teilen Südamerikas, gehört die Übertragung von Treponema pallidum pertenue, der Spirochaete, die Gaumenseuche verursacht. Weniger spezifisch ist, dass eine Reihe von Bakterienarten beim Menschen eine akute Bindehautentzündung (Pinkeye) hervorrufen kann, und verständlicherweise steigt die Häufigkeit von Pinkeye stark an, wenn relevante Chloropidae-Arten schwärmen.
Haemophilus influenzae Biotyp aegyptius ist der Erreger des hochgefährlichen brasilianischen Purpurfiebers; bei Kindern verläuft es in der Regel rasch tödlich, und verschiedene Arten der Familie Chloropidae sind potenzielle Überträger der Krankheit.
Als weiteres Beispiel für die Übertragung von Bakterien können einige Chloropidae-Arten verschiedene Stämme von Streptokokken-Hautinfektionen übertragen.
Neben bakteriellen Krankheitserregern können Chloropidae auch virale Krankheiten übertragen; insbesondere wurde nachgewiesen, dass sie das Vesikuläre Stomatitis-Virus übertragen.
Eine Batrachomyia-Larve parasitiert einen Litoria-genimaculata-Frosch
Auch wenn Chloropidae im Allgemeinen keine Wirbeltiere direkt angreifen, bilden die Larven der australischen Froschfliegen, Gattung Batrachomyia, eine Ausnahme. Sie verursachen Myiasis bei Fröschen. Die Mutterfliege ernährt sich, wie die meisten erwachsenen Chloropidae, hauptsächlich von Pflanzensäften, legt ihre Eier aber in der Nähe des Frosches ab. Die Larven graben sich eher unter die Körperhaut als unter den Kopf oder die Beine, und dort bilden sie sichtbare Schwellungen, in denen sie als Parasiten liegen und sich vermutlich von Blut und anderen Körperflüssigkeiten ernähren. Die meisten der Wirtsfrösche überleben, aber einige sterben.