Pater Seelos wurde 1844 zum Priester geweiht und diente in verschiedenen Pfarreien an der Ostküste und im Mittleren Westen als Mitglied der Redemptoristengemeinschaft in den Vereinigten Staaten. Er betreute mehrere Jahre lang Seminaristen und verbrachte einen Teil seiner Zeit als Priester damit, durch die Vereinigten Staaten zu reisen und in den Gemeinden zu predigen. Er war ein hervorragender Prediger und seine fröhliche Persönlichkeit half vielen Menschen, den Weg zurück zum Sakrament der Beichte zu finden. Pater Seelos verbrachte endlose Stunden im Beichtstuhl, und Tausende von Menschen erfuhren dort durch seine Sanftmut die Barmherzigkeit Gottes. Pater Seelos betonte die Bedeutung des täglichen Gebets und die Notwendigkeit, dem Gebet in Zeiten, in denen wir viel zu tun haben, schwierigen Versuchungen ausgesetzt sind oder uns im Glauben schwach fühlen, noch mehr als sonst Priorität einzuräumen.
Auf seinen Reisen predigte er in den 1860er Jahren in Pfarreien der Diözese Toledo, darunter: Saint Patrick Historic Parish in Toledo, Saint Francis de Sales Parish in Toledo, Sacred Heart Parish in Shelby, und Holy Trinity Parish in Bucyrus. Im Jahr 1866 wurde er Pfarrer der Pfarrei Saint Mary of the Assumption in New Orleans, wo er sich in seiner Arbeit auf die Armen konzentrierte. Zu dieser Zeit gab es in New Orleans eine Gelbfieberepidemie. Pater Seelos infizierte sich mit dem tödlichen Virus, während er den Armen diente. Er starb am 4. Oktober 1867 im Alter von 48 Jahren. Obwohl er noch nicht heiliggesprochen wurde, erklärte ihn Papst Johannes Paul II. im Jahr 2000 für „selig“.
Während der Messe, in der Pater Seelos für „selig“ erklärt wurde, sagte Papst Johannes Paul II. folgendes:
An den verschiedenen Orten, an denen er wirkte, brachte Pater Franz Xaver seine Begeisterung, seinen Opfergeist und seinen apostolischen Eifer ein. Den Verlassenen und Verlorenen verkündete er die Botschaft von Jesus Christus, „der Quelle des ewigen Heils“ (Hebr 5,9), und in den Stunden, die er im Beichtstuhl verbrachte, überzeugte er viele von der Rückkehr zu Gott. Heute lädt der selige Franz Xaver Seelos die Mitglieder der Kirche ein, ihre Verbindung mit Christus in den Sakramenten der Buße und der Eucharistie zu vertiefen. Durch seine Fürsprache mögen alle, die im Weinberg für das Heil des Volkes Gottes arbeiten, in ihrer Aufgabe ermutigt und gestärkt werden.