Isä Seelos vihittiin papiksi vuonna 1844, ja hän palveli eri seurakunnissa itärannikolla ja keskilännessä Redemptoristien yhteisön jäsenenä Yhdysvalloissa. Sen lisäksi, että hän ohjasi seminaarilaisia useiden vuosien ajan, hän vietti osan pappeudestaan myös matkustaen eri puolilla Yhdysvaltoja saarnaten seurakuntien lähetystyössä. Hän oli erinomainen saarnaaja, ja hänen iloinen persoonansa auttoi monia ihmisiä löytämään tiensä takaisin rippisakramenttiin. Isä Seelos vietti loputtomasti tunteja rippituolissa, ja tuhannet ihmiset kokivat siellä Jumalan armon hänen lempeytensä kautta. Isä Seelos korosti päivittäisen rukouksen tärkeyttä ja tarvetta asettaa rukous tavallista enemmän etusijalle aikoina, jolloin olemme kiireisiä, kohtaamme vaikeita kiusauksia tai tunnemme itsemme heikoksi uskossa.
Matkoillaan hän saarnasi 1860-luvulla Toledon hiippakunnan seurakunnissa, mm: Saint Patrick Historic Parish Toledossa, Saint Francis de Sales Parish Toledossa, Sacred Heart Parish Shelbyssä ja Holy Trinity Parish Bucyrusissa. Vuonna 1866 hänestä tuli Saint Mary of the Assumption Parishin pastori New Orleansissa, jossa hän keskittyi köyhien parissa toimimiseen. Tuona aikana New Orleansissa oli keltakuume-epidemia. Isä Seelos sai tappavan viruksen palvellessaan köyhiä. Hän kuoli 4. lokakuuta 1867 48-vuotiaana. Vaikka häntä ei ole vielä kanonisoitu pyhimykseksi, paavi Johannes Paavali II julisti hänet ”autuaaksi” vuonna 2000.
Messussa, jossa isä Seelos julistettiin ”autuaaksi”, paavi Johannes Paavali II sanoi näin:
Isä Franciscus Xavier toi eri paikoissa, joissa hän työskenteli, mukanaan innostuneisuutensa, uhrautuvaisen henkensä ja apostolisen innostuksensa. Hylätyille ja eksyneille hän julisti sanomaa Jeesuksesta Kristuksesta, ”iankaikkisen pelastuksen lähteestä” (Hebr 5:9), ja rippituolissa vietetyillä tunneilla hän sai monet vakuuttuneiksi siitä, että he palaavat Jumalan luo. Tänään autuas Franciscus Xavier Seelos kutsuu kirkon jäseniä syventämään liittoaan Kristuksen kanssa katumuksen ja eukaristian sakramenteissa. Hänen esirukouksensa kautta rohkaistukoot ja vahvistukoot tehtävässään kaikki, jotka työskentelevät viinitarhassa Jumalan kansan pelastamiseksi.