Ecuadorissa on kolme maantieteellistä pääaluetta sekä saaristoalue Tyynellämerellä.Costa koostuu maan länsiosassa sijaitsevasta matalasta litoraalista. Sen rannikot ovat Tyynellämerellä.Sierra-alue on maan keskiosassa kulkeva vuoristoinen, korkealla sijaitseva pystysuora vyöhyke. Tämän alueen pinnanmuodostus on seurausta sen varrella kulkevasta Andien vuoristosta.Oriente (kirjaimellisesti ”itä”) käsittää maan itäosassa sijaitsevat Amazonin sademetsäalueet, joiden pinta-ala on vajaa puolet maan kokonaispinta-alasta, mutta joilla asuu alle 5 % väestöstä.
Ecuadorin pääkaupunki on Quito, ja se sijaitsee Pichinchan maakunnassa Sierra-alueella. Sen suurin kaupunki on Guayaquil, joka sijaitsee Guayasin maakunnassa Costassa. Cotopaxi, joka sijaitsee Quiton eteläpuolella, samannimisessä naapuriprovinssissa, on maan ja maailman korkein aktiivinen tulivuori. Ecuadorin korkein huippu on Chimborazo, joka kohoaa noin 6310 metriä merenpinnan yläpuolelle.