Influenssavirusten, jotka aiheuttavat flunssan kaltaisia hengitystieinfektioita, yhteisinfektio on harvinaista. Koinfektiota influenssa A:n ja B:n, kahden tärkeimmän influenssavirustyypin, kanssa esiintyy alle 2 prosentissa tapauksista, mutta se ei näytä vaikuttavan kokonaistulokseen.
Koinfektiota flunssan kanssa on aiemmin ollut vaikea tutkia, koska flunssan aiheuttavien virusten määrä on suuri. Viime vuosina molekyyligenetiikan edistysaskeleet ovat kuitenkin antaneet tutkijoille mahdollisuuden tutustua rinovirukseen, joka on tavallisin flunssan aiheuttaja.
Vuonna 2009 tutkijat pystyivät sekvensoimaan 99 tunnetun rinoviruskannan koko geneettisen materiaalin. He havaitsivat, että yhteisinfektio useiden kantojen kanssa on yleinen ilmiö. He havaitsivat myös, että yhteisinfektio tarjosi viruksille mahdollisuuden mutaantua uusiksi kannoiksi.
Diagnostisia testejä monille flunssaa aiheuttaville viruksille on nyt saatavilla kaupallisesti. Vuonna 2013 lääkärit käyttivät näitä testejä tutkiessaan 225 päivähoidossa olevaa lasta. Lähes puolella oli sairastuessaan useampi kuin yksi virus. Lapset, joilla oli useita viruksia, eivät näyttäneet olevan sairaampia kuin ne, joilla oli vain yksi virus, mutta he pysyivät sairaina pidempään. Nämä havainnot vahvistettiin hiljattain kaikkien julkaistujen tutkimusten systemaattisessa katsauksessa.
Vaikka voit sairastua kahteen flunssaan kerralla, olosi ei luultavasti ole yhtään pahempi kuin yhden flunssan aikana. Ero, jonka saatat kokea, on se, että olet sairaana pidempään kuin muutoin saattaisit odottaa.