Service ChIP-seq
L’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP), une méthode expérimentale classique pour étudier l’interaction entre les protéines et l’ADN, est largement utilisée dans des domaines connexes tels que la modification des histones et l’expression des gènes régulée par des facteurs de transcription spécifiques. Avec le développement et la maturité de la technologie NGS, le séquençage ChIP (ChIP-seq), une intégration des expériences d’immunoprécipitation de la chromatine avec le séquençage à haut débit, permet un criblage efficace et précis des sites de liaison des protéines dans le génome. En outre, les sites de liaison à l’ADN associés à des protéines spécialisées peuvent être comparés dans différents types de cellules et de tissus en raison de l’origine des cellules vivantes dans les complexes protéine-ADN.
Intro to ChIP Sequencing
ChIP-seq, comme RNA-seq, semble mystérieux et compliqué, mais il ne l’est pas. Voici une introduction douce au sujet qui couvre les bases derrière l’expérience, comment les données sont traitées et les sortes de choses que vous pouvez faire avec.
Directeur d’échantillon
| Service | Type d’échantillon | Minimum de quantité | Concentration minimale | Qualité |
|---|---|---|---|---|
| ChIP-seq | ADN | 10ng | 1 ng/µL | Fragmenté à 100-300bp |
*Mesurer la concentration avec Qubit est fortement recommandé.
*Veuillez fournir les résultats du Bioanalyseur pour votre échantillon s’il est disponible.
*Veuillez fournir l’ADN dérivé du ChIP dans de l’eau exempte de nucléase. Si une RNase est détectée lors de l’exécution de la puce à ADN dans notre Bioanalyseur 2100, le coût du nettoyage de la contamination causée par la RNase sera facturé.
Flux de service
Pipeline d’analyse (usage général)
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