A part l’irritation cependant, les mouches se déplacent fréquemment d’un hôte à l’autre et de l’anus au visage ou aux lésions ouvertes ; en conséquence, elles peuvent être des véhicules dangereux pour de nombreux organismes infectieux. Des exemples bactériens, en particulier dans les Caraïbes et dans certaines parties de l’Amérique du Sud, incluent la transmission de Treponema pallidum pertenue, le spirochète qui cause le pian. Moins spécifiquement, n’importe laquelle d’une gamme d’espèces bactériennes peut causer la conjonctivite aiguë humaine (pinkeye), et, de manière compréhensible, l’incidence de la pinkeye a tendance à augmenter fortement lorsque les espèces pertinentes de Chloropidae pullulent.
Haemophilus influenzae biotype aegyptius est l’agent pathogène qui cause la très dangereuse fièvre purpurique brésilienne ; chez les enfants, elle est généralement rapidement fatale, et diverses espèces de la famille Chloropidae sont des transmetteurs potentiels de la maladie.
Autre exemple de transport bactérien, certaines espèces de Chloropidae peuvent transporter diverses souches d’infections cutanées streptococciques.
En dehors des agents pathogènes bactériens, les Chloropidae peuvent également transmettre des maladies virales ; il a notamment été démontré qu’ils transportent le virus de la stomatite vésiculaire.
Une larve de Batrachomyia parasite une grenouille Litoria genimaculata
Bien que les Chloropidae n’attaquent généralement pas directement les vertébrés, les larves des mouches-grenouilles australiennes, du genre Batrachomyia, font exception. Elles provoquent la myiase chez les grenouilles. La mouche mère, comme la plupart des Chloropidae adultes, se nourrit principalement de jus de plantes, mais elle pond ses œufs près de la grenouille. Les larves s’enfouissent sous la peau du corps plutôt que sous la tête ou les pattes, et y forment des gonflements visibles dans lesquels elles gisent en tant que parasites, se nourrissant probablement de sang et d’autres fluides corporels. La plupart des grenouilles hôtes survivent, mais certaines meurent.