Combien d’antibiotiques sont produits par le genre Streptomyces?

Streptomyces est le plus grand genre producteur d’antibiotiques du monde microbien découvert à ce jour. Le nombre de composés antimicrobiens rapportés par les espèces de ce genre par an a augmenté de façon presque exponentielle pendant environ deux décennies, suivi d’une augmentation régulière pour atteindre un pic dans les années 1970, et avec un déclin substantiel à la fin des années 1980 et 1990. Le nombre cumulé montre une courbe sigmoïde beaucoup plus plate que ce qu’une équation logistique pourrait prédire. Nous avons tenté d’adapter un modèle mathématique à cette courbe afin d’estimer le nombre d’antimicrobiens non découverts de ce genre et de prévoir les tendances dans un avenir proche. Un modèle supposant que les efforts de dépistage sont encouragés par le succès de l’année précédente et que la probabilité de trouver un nouvel antibiotique est fonction de la fraction d’antibiotiques non découverts jusqu’à présent a offert un bon ajustement après optimisation des paramètres. Le modèle a estimé que le nombre total de composés antimicrobiens que ce genre est capable de produire est de l’ordre de 100 000, dont une infime partie a été découverte jusqu’à présent. Le déclin de la pente semble être dû à une diminution des efforts de dépistage plutôt qu’à un épuisement des composés. Laissée à elle-même, la pente deviendra nulle dans la prochaine ou les deux prochaines décennies, mais si les efforts de criblage sont maintenus constants, le taux de découverte de nouveaux composés ne diminuera pas pendant plusieurs décennies.