Karenia brevis (Davis) Hanson et Moestrup est un protiste dinoflagellé unicellulaire qui provoque des efflorescences algales nuisibles qui se produisent chaque année dans le Golfe du Mexique. Ces « marées rouges » provoquent la mort de nombreux animaux marins et des maladies humaines par la production de neurotoxines très puissantes connues sous le nom de brevetoxines. La compréhension des mécanismes moléculaires qui contrôlent la croissance et la persistance des efflorescences de K. brevis est essentielle à la compréhension de la formation des efflorescences algales nuisibles et constitue une condition préalable à l’élaboration de stratégies de contrôle. Les espèces de Karenia (et d’autres dinoflagellés contenant de la fucoxanthine) occupent également une position critique parmi les algues en ce qui concerne l’évolution des plastides (organites photosynthétiques). Ces taxons ont subi une transition génomique remarquable, passant d’une condition ancestrale dans laquelle leur génome plastidial comprenait un petit nombre (environ 16) de minicercles à gène unique (les gènes plastidiques restants étant codés par le noyau) à un plastide présumé typique par endosymbiose tertiaire (où un organisme engloutit un organisme symbiotique qui a déjà englouti un autre organisme, qui à son tour a englouti encore un autre organisme). Des ébauches de séquences seront également générées pour les génomes plastidiques et mitochondriaux de K. brevis et de sa sœur Karlodinium micrum afin de mieux comprendre l’endosymbiose plastidique et le transfert de gènes organellaires.
Participants au projet CSP : Debashish Bhattacharya (auteur, Univ. de l’Iowa) et Frances Van Dolah (Natl. Oceanic and Atmospheric Admin.)