Servizio ChIP-seq
L’immunoprecipitazione della cromatina (ChIP), un classico metodo sperimentale per studiare l’interazione tra proteine e DNA, è ampiamente utilizzato in campi correlati come la modifica degli istoni e l’espressione genica regolata da specifici fattori di trascrizione. Con lo sviluppo e la maturità della tecnologia NGS, il sequenziamento ChIP (ChIP-seq), un’integrazione degli esperimenti di immunoprecipitazione della cromatina con il sequenziamento ad alto rendimento, permette uno screening efficiente e accurato dei siti di legame delle proteine in tutto il genoma. Inoltre, i siti di legame al DNA associati a proteine specializzate possono essere confrontati in diversi tipi di cellule e tessuti a causa dell’origine delle cellule viventi in complessi proteina-DNA.
Intro a ChIP Sequencing
ChIP-seq, come RNA-seq, sembra misterioso e complicato, ma non lo è. Ecco una leggera introduzione all’argomento che copre le basi dell’esperimento, come vengono elaborati i dati e il tipo di cose che si possono fare con essi.
Campione guida
| Servizio | Tipo di campione | Minima quantità | Concentrazione minima | Qualità |
|---|---|---|---|---|
| ChIP-seq | DNA | 10ng | 1 ng/µL | Frammentato a 100-300bp |
*Misurare la concentrazione con Qubit è altamente consigliato.
*Si prega di fornire i risultati del Bioanalyzer per il vostro campione, se disponibile.
*Si prega di fornire il DNA derivato da ChIP in acqua priva di nucleasi. Se viene rilevata una RNasi durante l’esecuzione del chip di DNA nel nostro Bioanalyzer 2100, il costo della pulizia della contaminazione causata dalla RNasi sarà addebitato.
Flusso di lavoro del servizio
Pipeline di analisi (uso generale)
