Ordinato sacerdote nel 1844, padre Seelos servì in varie parrocchie della costa orientale e del Midwest come membro della comunità redentorista negli Stati Uniti. Oltre a fare da mentore ai seminaristi per diversi anni, trascorse anche una parte del suo sacerdozio viaggiando per gli Stati Uniti predicando missioni parrocchiali. Era un eccellente predicatore e la sua personalità gioiosa ha aiutato molte persone a ritrovare la strada verso il Sacramento della Confessione. Padre Seelos trascorse infinite ore nel confessionale e migliaia di persone sperimentarono la misericordia di Dio attraverso la sua gentilezza. Padre Seelos sottolineò l’importanza della preghiera quotidiana, e la necessità di dare priorità alla preghiera anche più del solito nei momenti in cui siamo occupati, affrontiamo tentazioni difficili, o ci sentiamo deboli nella fede.
Durante i suoi viaggi, egli predicò nelle parrocchie della Diocesi di Toledo durante gli anni 1860, tra cui: Saint Patrick Historic Parish a Toledo, Saint Francis de Sales Parish a Toledo, Sacred Heart Parish a Shelby, e Holy Trinity Parish a Bucyrus. Nel 1866, divenne pastore della parrocchia di Santa Maria dell’Assunzione a New Orleans, dove concentrò il suo ministero sui poveri. In quel periodo ci fu un’epidemia di febbre gialla a New Orleans. Padre Seelos prese il virus mortale mentre serviva i poveri. Morì il 4 ottobre 1867 all’età di 48 anni. Anche se non è ancora canonizzato come santo, Papa Giovanni Paolo II lo ha dichiarato “beato” nel 2000.
Durante la messa che ha dichiarato padre Seelos “beato”, Papa Giovanni Paolo II ha detto questo:
Nei vari luoghi dove ha lavorato, padre Francesco Saverio ha portato il suo entusiasmo, il suo spirito di sacrificio e il suo zelo apostolico. Agli abbandonati e agli smarriti predicava il messaggio di Gesù Cristo, “fonte di salvezza eterna” (Eb 5,9), e nelle ore trascorse nel confessionale convinceva molti a tornare a Dio. Oggi il Beato Francesco Saverio Seelos invita i membri della Chiesa ad approfondire la loro unione con Cristo nei sacramenti della Penitenza e dell’Eucaristia. Per sua intercessione, possano tutti coloro che lavorano nella vigna per la salvezza del popolo di Dio essere incoraggiati e rafforzati nel loro compito.