Uno dei modi più efficaci per gestire il marciume della spiga di Cladosporium è identificare la sua presenza il più presto possibile e gestire l’ambiente in cui il mais viene coltivato e conservato. La ricerca di marciume della spiga nei campi, che dovrebbe essere fatta ogni due settimane, e l’analisi della contaminazione da micotossine è il primo passo per valutare la presenza o meno di marciume della spiga in generale, anche se nessuna micotossina è associata a C. herbarum nello specifico. I campi problematici possono essere caratterizzati dall’avere più del 10% di spighe che contengono il fungo sul 10-20% del grano. Le pannocchie infette dovrebbero essere raccolte il prima possibile, pulite per rimuovere le particelle fungine, asciugate al 15% di umidità o meno immediatamente per fermare la crescita del fungo, e conservate in un ambiente aerato al 13-14% di umidità tra 35 e 40 °F per fermare la riproduzione asessuata e la diffusione del fungo. Questi controlli culturali possono diminuire notevolmente la perdita di resa.
C. herbarum ha bisogno di un’apertura per infettare il suo ospite, quindi i controlli culturali che impediscono ai chicchi di essere feriti impedirebbero l’infezione di nuove piante. Gli insetticidi possono essere usati tempestivamente per controllare chimicamente la piralide del mais e la piralide europea che danneggiano i chicchi, permettendo all’inoculo di entrare all’interno. Inoltre, le mietitrebbie dovrebbero essere igienizzate e regolate correttamente per minimizzare i danni ai chicchi durante il raccolto.
Un altro modo meno efficace per gestire la percentuale di raccolto infetto è piantare varietà resistenti e scartare quelle più suscettibili. Tuttavia, vale la pena menzionare che nessun ibrido è resistente a tutti i funghi della marcescenza della spiga e le varietà resistenti non sono ampiamente disponibili, quindi anche se una varietà può essere resistente al marciume della spiga Cladosporium, può essere a rischio di infezione da un altro fungo della marcescenza della spiga. Una maggiore copertura della buccia e un rivestimento dei semi più forte rendono anche l’ospite più difficile da infettare in primo luogo. La rotazione delle colture sarebbe probabilmente un metodo di controllo culturale efficace per eliminare l’agente patogeno, ma richiederebbe che tutti i coltivatori di mais di una contea si conformassero per avere un impatto significativo sui livelli di inoculo. Se tutti i coltivatori di mais non fossero in sintonia con la rotazione delle colture, le spore dei campi vicini verrebbero semplicemente trasportate dal vento in altri campi e impedirebbero ai livelli di inoculo di scendere a livelli ragionevoli.