カロライナインコの絶滅は人為的な原因によるもの、DNA配列解析で明らかに

バルセロナの進化生物学研究所（IBE、ポンペウ・ファブラ大学（UPF）とスペイン国立研究会議（CSIC）の共同研究所）とコペンハーゲン大学のグローブ研究所の研究者たちは、20世紀初頭に絶滅したとされるカロライナインコのゲノムを公開したのです。 1218>

カロライナインコ（Conuropsis carolinensis）は、北米を代表する鳥で、1918年にシンシナティ動物園の最後の標本が死亡し、20世紀初頭に絶滅したと宣言されました。 地球上で最も北に位置する緯度に生息するオウムの仲間で、ニューイングランド南部からメキシコ湾、コロラド州東部にまで分布していた。 1218>

数百羽の群れで騒がしく飛び回るにもかかわらず、19世紀の最後の数十年間は、帽子を飾る羽を得るためもあり、広範囲に狩猟された。 しかし、その絶滅の原因については、いまだ議論の余地がある。 その過剰な死亡率は、最近の生息地の破壊や活発な狩猟と関連している可能性が高いのですが、生息域がますます斑になってきたことや、家禽類の病原菌にさらされたことも生存に悪影響を及ぼした可能性があります。

研究者たちは、エスピネルベス（スペイン、ジローナ）の個人コレクションに保存されている、カタロニア人博物学者マリア・マスフェレール（1856-1923）が収集した帰化標本の脛骨と足指パッドをサンプリングして、絶滅したカロライナインコのゲノムを初めて完全に再構築しました。 この絶滅した鳥の完全なゲノムをマップするためには、まず現存する近縁種である南米の Aratinga solstitialis（サンインコ）のゲノムを配列しなければなりませんでした。

両ゲノムと他の何百もの鳥類のゲノムの解析により、カロライナインコとサンインコの分岐は約300万年前でパナマ地峡の閉鎖と一致していると判定されました。

カロライナインコは、鳥には影響しないが捕食者には悪名高い強力な毒を含む植物であるコガネムシを好んで食べていたことがわかりました。 ゲノム解析の結果、この毒物と相互作用することが知られている2つの極めて保存されたタンパク質において、このコガネムシ食への適応の可能性が明らかになりました。

研究者はまた、絶滅危惧種に時々見られる近親交配や集団減少の兆候をゲノムで探りましたが見つからず、その急速な絶滅は主に人間の手によるものであると示唆されました。 現在、専門家たちはカロライナインコの脱絶滅は可能だろうかと考えている。 「カロライナインコはすべての脱絶滅リストに掲載されているにもかかわらず、最も近い近縁種であるサカオインコとの間に、劇的に変化すると予測される何百もの遺伝子変化が見つかり、このような事業を行うことが非常に難しいことを示しています」と、ラルエザ・フォックスは言います。

鳥のゲノムから絶滅の歴史を再構築するために開発した方法は、将来、他の考えられる人類による絶滅の予測や、保全計画の適時適用により、絶滅寸前の種をさらに守るために使えるかもしれません。 「長期的な人口減少が種のゲノムに特定のシグナルを残すため、私たちはゲノミクスを使って他の絶滅プロセスのダイナミクスをテストし、それらが完全に人間に起因するかどうかを推測することができます」と、Lalueza-Foxは結論付けています。 IBEの博士課程の学生で、当時TV3の番組のレポーターだったPere Renomは、20世紀初頭にカタルーニャの博物学者がアメリカで採集したカロライナインコの標本が、エスピネルベス（スペイン、ジローナ）の個人コレクションに保存されていることを発見したのです。 レノムは、TV3の番組で脱絶滅を語るために、剥製からゲノムを復元する全過程を撮影するようラルエサ＝フォックスに連絡したのです。 “Renomは、標本からDNAを取り出すことに興味があるかどうか私に連絡し、この話は2年後にIBEで行われたこの北アメリカの鳥の最初の完全なゲノムで終わった “とLalueza-Foxは説明する。”発見の完全な物語は、最近2019年の科学普及の最高のビデオとしてスペインPrismas賞を受賞した「Desextinció： reviure una espècie」というquèquicomの回で見ることができます。