核酸
多くの生体分子と同様に核酸は高分子で、繰り返し単位からなる長い分子です。 核酸では、繰り返し単位はヌクレオチドである。 ヌクレオチドは、5つの炭素の糖、窒素を含む塩基、およびリン酸基から構成されている。 核酸には、デオキシリボ核酸（DNA）とリボ核酸（RNA）の2種類があり、それぞれのヌクレオチドに含まれる糖と、ヌクレオチドが含むことのできる4つの塩基がわずかに異なっている。
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| DNA Nucleotide | |
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| RNA 分子の一部分の構造です。 |
糖モエティの2’炭素に水酸基があることに注目。
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| Adenine – （アデニン）。 DNAとRNA |
グアニン – DNAとRNA |
チミン –
DNA と RNA |
Thymine
DNA and RNA |
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| Cytosine -」とあるように、CyotoはDNAの一種である。 DNAとRNA |
ウラシル – RNAのみ |
電気泳動にとって重要なことは、リン酸基がイオン化することです。 核酸は大きな正味の負電荷を帯びている。
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| 各核酸のリン酸基は負の形式の電荷を持っています。 各ヌクレオチドは同じ電荷を持っているので、異なる核酸分子の電荷／質量比はほぼ同じである。 | |
DNA と RNA にはそれぞれ、4 つの可能な塩基（DNA ではアデニン、グアニン、チミン、シトシン、RNA ではアデニン、グアニン、ウラシル、シトシン）の集合に対応する、4 つの可能なヌクレオチドが含まれています。 それぞれの塩基は、水素結合の対称性に基づいて、他の3つの塩基のうちの1つに対して特定の親和性を示す。 窒素塩基のアデニンは、チミン（RNAではウラシル）と「塩基対」を形成する。 グアニンはシトシンと “塩基対 “を形成する。 塩基対の関係から、DNAやRNAは一本鎖や二本鎖として存在することができます。 二本鎖は、塩基対形成によって結合した2本の相補的な鎖からなる。
The base pairing of two complementary strands allows nucleic acid molecules to assume a double stranded form.
Base pairing can also occur in single stranded DNA or RNA.The double stranded form of two complementary strasand from a base pairing. あるヌクレオチド配列を含む部分がループバックし、同じ鎖の相補的な部分と塩基対になることがよくあります。 これは分子の3次元構造に影響を与え、電気泳動による分離に影響を与える。 一般に、DNAやRNAの長い鎖は、塩基対を形成しており、二本鎖か、内部で対になっている一本鎖のどちらかで発見される。
塩基対形成は、二本鎖に限らず、同一分子内でも起こりうることです。
二本鎖DNAやRNAの電気泳動はネイティブゲル電気泳動と呼ばれ、その結果、解釈の難しい電気泳動結果が得られることがある。 一本鎖のDNAやRNAの電気泳動は、変性条件下で行われる。 化学的変性には、ホルムアミドと尿素がよく使われる。 これらの物質は、窒素塩基間の水素結合を破壊し、塩基対形成の効果を除去する作用がある。 通常、電気泳動の変性過程では、試料調製からゲル形成まで、ホルムアミド、尿素、熱の組み合わせが用いられる。 変性条件の目的は、一本鎖の分子を確保し、同じDNAまたはRNA分子の異なるセクション間の塩基対形成によるコンフォメーションの変化を防ぐことである。
ホルムアミドと尿素は、核酸分子の塩基と新しい水素結合を形成することによって、DNAまたはRNAの変性を達成し、ベースペアリングにつながる水素結合を破壊する
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