大腸の腸腺は、しばしば大腸クリプトと呼ばれる。 大腸の上皮内面には、大腸陰窩と呼ばれる侵入口が点在している。 大腸クリプトは微小な肉厚の試験管のような形状をしており、管の長さ方向に中央の穴（クリプトルーメン）が開いている。 8127>
これらの画像では、細胞がチトクロームc酸化酵素サブユニットI（CCOIまたはCOX-1）と呼ばれるミトコンドリアタンパク質を生成する場合、細胞が茶色またはオレンジ色に染色されている。 細胞の核（クリプトの壁を覆っている細胞の外縁に位置する）はヘマトキシリンで青灰色に染色されている。 パネルCとDに見られるように、クリプトは約75から約110の細胞の長さである。 平均的なクリプトの外周は23セルである。 この画像から、1つのクリプトあたりの平均細胞数は約1725〜2530個であることが示された。 また、1つのクリプトあたり1500〜4900個の細胞が観察された。 細胞はクリプト底部で産生され、クリプト軸に沿って上方に移動し、数日後に大腸内腔に排出される。
パネルAの画像から推定すると、大腸上皮1平方ミリメートルあたり約100個のクリプトが存在する。 ヒトの大腸の長さは平均160.5cm（盲腸底部から大腸接合部まで測定）で、80cmから313cmの幅がある。 大腸の内周は平均6.2cmである。 したがって、ヒトの大腸の内表面上皮の面積は、平均して約995 cm2で、これには995万（1000万に近い）クリプトが含まれる。
ここに示した4つの組織切片では、腸腺の多くがCCOI遺伝子にミトコンドリアDNA変異を持つ細胞で、ほとんどが白く見え、その主色は核のブルーグレーの染色色であった。 パネルBに見られるように、3つの小嚢の幹細胞の一部がCCOIに変異を有しているようで、それらの幹細胞から生じた細胞の40％から50％が、横断面において白いセグメントを形成する。
全体として、CCOI欠損小嚢の割合は40歳以前は1％未満であり、その後年齢とともに線形に増加する。 パネルCではクリプトが分裂して2つのクリプトを形成しており、パネルBでは少なくとも1つのクリプトが分裂しているように見えるように、大腸のクリプトは分裂によって繁殖することができる。 CCOI欠損クリプトの多くは、2つ以上のCCOI欠損クリプトが隣接するクリプトのクラスター（クリプトのクローン）である（パネルD参照）
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