1. 生命体とその遺伝情報
一般に、細胞は情報の生成、複製、加工が可能であることから、生命の最小単位であると判断される。 細胞にはさまざまな部分があり、それらは決められた機能とプロセスを持ち、環境や外部からの影響に反応できる機械となっている。 翻訳/転写のように、複製によって情報を受け取り、処理し、創造する能力があれば、細胞は完全に独立したシステムであり、したがって独立した生命体である。
細胞は2つの異なるタイプに分けることができる。 1つは、最も単純で基本的な細胞構造の概念である。 これは、進化の過程でより進化した細胞が現れるまで、地球上の唯一の生命体であった細菌や古細菌が使用しています。 これらの細胞は原核細胞と呼ばれ、theothersはより複雑な細胞構造を受け継ぐ真核細胞です。 この2つの細胞の主な違いは、情報の保存の仕組みと形態にあります。 原核細胞の情報は、生物学用語でDNAと呼ばれ、折り畳まれた構造で保存され、高密度のスーパーコイル状のひも状になって細胞内を浮遊している。 一方、真核細胞には核と呼ばれる核があり、ここにDNAが保存され、さらに使用される。 DNAは、ヒストンと呼ばれるタンパク質に巻きついている。 核の構造は、特定の断片が核膜の穴を通って核の封じ込めを離れることができるように、句読点が付けられています。 DNA-構造と機能
DNA とは desoxyribonucleic acid の略で、日本語に訳すと「脱酸素核酸」です。 DNAは遺伝情報の構造を記述したもので、ポリヌクレオチドをベースにしています。 ポリヌクレオチドは、原核生物だけでなく、真核生物のすべての生きた細胞で同じであるヌクレオチドの長い文字列を表します。 各ヌクレオチドは、4つの核酸塩基のうちの1つをベースにしている。 アデニン、シトシン、チミン、グアニンの4つの核酸塩基のうちの1つをベースにしています。 アデニンとチミン、グアニンとシトシンは互いに相補的であり、相補的な核酸塩基の配列によって一定の構造を形成することが可能である。 ヌクレオチド自体は、リン酸分子、糖分子、核酸塩基から構成されている。 異なる核酸塩基は強い水素結合で結ばれており、核酸塩基の決められた配列を維持しながら、DNAに一定の柔軟性を与えている。 細胞核内では、DNAは二重らせんの形で利用でき、核の中心できつくボール状に巻き上げられたときにスペースを取らないようになっている(Lara, 2009)。 ララによれば、各ヌクレオチドは、その5`および3´末端において、他の任意のヌクレオチドと「頭-尻尾結合」することができる。 つまり、すべてのヌクレオチドは、他のヌクレオチドと相互作用し、結合するために、2つの異なる末端を持つ定義された構造を持っているのである。 この現象は、生命体の成長と発達に不可欠なDNA配列を定義しています。
DNAの配列は、ジェームズ・デューイ・ワトソンとフランシス・クリックの両科学者によって初めて暗号化されました。 DNA の配列の発見により、「遺伝暗号の普遍性」とも呼ばれ、DNA の背後にある化学的性質から、核酸塩基による DNA の暗号化と細胞内の情報の分子構造に焦点が移されました (Lyre, 2002)。
DNAの配列は、タンパク質の構築や細胞の他の動作機能に関する情報を格納するために使用されています。 この情報は、転写と翻訳を通じて、細胞内で新しいタンパク質を構築するために複製され、読み取られることができます。 生物学における情報の複製プロセス
細胞は、長期的に細胞の生存を支えるために、翻訳を通じて、タンパク質を複製する能力を持っています。 タンパク質はアミノ酸を基にしており、すべてのタンパク質はその用途と機能によって区別される。 細胞自体は2つの異なるコンパートメントに分かれています。 細胞質は、細胞の内側のすべての部分を取り囲み、これらの部分は、細胞壁の封じ込めを介して自由に浮遊することができます。 一方、核は丸みを帯びた形状をしており、細胞のDNAやその情報を管理する装置などが格納されています。 あるヌクレオチド配列の活性化や遮断も、このような装置で実現することができる(Lara, 2009: 3)。 核と細胞質は、核膜によって隔てられており、この核膜が細胞内の情報の流れの異なる段階を物理的に分割している。 Lyre (2003: 91) によれば、情報処理は転写と翻訳という2つの異なる段階から構成されている。 さらに、成長による細胞分裂の必要性に応じて、DNAを複製することができる。
転写のプロセスは、DNA配列をより可動性の高い情報形態にコピーする行為について説明しています。 この形態はmRNAと呼ばれ、メッセンジャー・リボ核酸の略である。 メッセンジャーRNAが完全に発達すると、核の壁の穴を通って、情報処理の次の段階である細胞質に入る。 翻訳
細胞質では、細胞情報を処理する次の段階として、翻訳過程が行われる。 リボソームと呼ばれるタンパク質がmRNAに付着し、mRNAの最初のコドンにtRNAを付加し始める。 mRNAの構造に付着した核酸塩基の異なる配列に合わせて、異なるtRNAが存在します。 核酸塩基の配列を読み取ることで、アミノ酸が構築され、タンパク質が生成されます(bioadmin, 2013)。 このタンパク質は細胞質内を移動し、細胞の内部と外界を隔てる細胞メッシュに組み込まれます。 メッシュの内側に配置されると、theproteinは、さまざまな機能を実行するために開始することができます。
細胞が一定の大きさになると、DNAを複製する行為が必要になります。 DNAは、新しい細胞に、タンパク質を生成し、適切な方法で機能するための一連の情報を与えるために複製される。 まず、DNAの二重らせんを分離し、分離した相補的な核酸塩基を再び対応するものとマッチングさせて、同じ配列のセットを維持し、したがって、元の細胞のDNAを通じて与えられた遺伝情報を維持するのである。
4. DNAの記憶容量
アミノ酸は3つの核酸塩基を含むコドンを基にしています。 コドンの3つのソケットを埋める可能性が4種類あることを考慮すると、コドンの複雑さを判断することができる。 1つの三重項コドンの構成は、64種類のコドンを作ることになります。 我々は100コドンから成るDNA文字列を取る場合は、wehaveの代替insequences。 単純な生命体、例えば大腸菌のDNAに含まれる平均ヌクレオチドはN=である。 つまり、配列の交替について計算すれば、それは(Lyre, 2002, p.94)を意味する。 このような記憶容量は、私たちの想像をはるかに超えている。 この地球上の最も単純な生命体にとってさえ、記憶されたプロセスや物質に関する情報は複雑すぎて理解できないのである。
5. タンパク質生産とDNAの機能の意味論
意味論の定義は「言語における意味の研究」(Cambridge, 2014)であり、DNAコーディングと細胞間相互作用における情報の流れの言語として細胞に適用することが可能である。 前述したように、遺伝情報はヌクレオチドとコドンのコード化を通じて細胞のDNAに格納される。 細胞にとっての情報の重要性は、この決定されたヌクレオチドの配列を解読してアミノ酸を生成し、細胞の生存に不可欠なタンパク質を作り出すことである。 これらのタンパク質は、栄養素を交換したり、cellstructureを維持するための細胞のメッシュで明確なdetailedfunctionを持っています。 細胞自体の意味は、ヌクレオチド配列を解読する機能性に基づいています。 タンパク質が合成された後、設定された機能が与えられ、タンパク質がそのために設計された方法で機能するときにのみ、コードは有用である。 Laraは論文の中で、「特定の部分の活性化または非活性化を媒介する外部調節因子が存在し、それはタンパク質の外部のエージェントによって調節されることもある」(Lara, p.3)と述べている。 この論文で問題になっているのは、DNAに格納された情報とタンパク質への影響との関係が複雑であることである。 したがって、情報の流れは双方向であると考えなければならず、DNAやタンパク質は、DNAの断片を翻訳するという最初のシグナルの発信者と見なすことはできない(Lyre, 2002)
6.タンパク質は、DNAの断片を翻訳するという最初のシグナルの発信者である。 DNAのシグナル-転写と情報の流れ
生物情報の処理と保存に影響を与える要因の1つはヌクレオイドの配列である。 しかし、それ以外にも、DNAの他の構造的特性が記憶コーディングとして評価されることがある。 DNA分子の部分における電子的構成またはトポロジー,トポロジーは、「曲げや伸ばしなどの特定の変換の下で不変である幾何学的形態のそれらの特性の研究」(辞書.com、2017)、その3次元構造におけるtheDNAの特性(Lyre、2002、99ページ)を表しています。 DNAstructureのこれらの機能的特性は、異なる生命体のincell DNAの記憶容量や情報コーディングの仕方に影響を与えることができる。 ジャンクDNA」と呼ばれる現象は、一般的なDNAの中で繰り返されることによって、これらの特性を悪化させることもある。 細胞内にも要因があり、制御分子、酵素、構造タンパク質などが、細胞内の生物学的情報に一定の影響を与える。 ある種の遺伝子は、培養されたタンパク質の構造を決定するために、ある種の方法で発現される。 転写の過程で、前述の構造タンパク質は、全体的なタンパク質組成を変更するために、特定の種類の遺伝子発現を活性化または不活性化することができます。
細胞内因子と同様に、細胞外因子も情報処理を決定する。 これらは2つに分けて考えることができる。 一方は、その小さな構造から細胞膜を通過し、特殊な核内受容体に付着して、DNAの翻訳過程や後の翻訳過程のためのRNAの合成過程を変化させる分子であり、もう一方は、細胞膜を通過し、特殊な核内受容体に付着して、DNAの翻訳過程や後の翻訳過程のためのRNAの合成過程を変化させる分子である。 一方、外部からの電荷は、タンパク質分子の立体構造を変化させ、細胞としての機能を変化させる(Lyre, 2002, p. 100)。
7 情報コーディングの影響要因
ライアの説明では、情報を処理する作用は、数十億年の進化という概念を経て発達したものである。 そうでなければ、DNAの情報を変化させ、タンパク質合成のために細胞のDNAの形で情報をコード化しなければ、細胞が細胞構造を発達させる意味はない(Lyre, 2002, p.103)。 進化の概念は、すべての複雑な生き物が基づいているDNAシステムの背後にある主要な力としてbedescribedすることができます。 環境と、共存する生命体と相互作用からなるこの複雑なシステムの中にある要因が、生きている細胞の中にある生物情報を進化させる原動力となるのです。 それは「新しい細胞が、個々の生き物の表現型を支える構造を通時的に再構築すること」を決定する(Díaz, 2017, p.6)。 ディアス氏が述べたように、遺伝情報の進化は、生物が相互作用する環境によって決定されるため、生物情報を長い時間をかけて変化させ、個々の存在の表現型を調整する。 彼はこれを「形態形成プロセスにおける新たな決定がエピジェネティックに行われる基質」(Díaz, 2017, p.6)と表現している。 また、lifeformscanの神経容量は、与えられた情報を処理するために異なることができます。 例えば、ヒトは、その生物学的情報によってより多くのニューロン能力を持ちうる別の生命体として、より多くの難しい情報やプロセスを処理することができるが、脳の構造とニューロン接続は複雑な思考のフル能力を可能にすることはできない」
Lifedevelopment is determined by the instructions which lies within the genomes and external factors based on environment.これは、ゲノム内にある命令と環境に基づく外的な要因によって決定される。 そのため、現在の地球上の生命が、バクテリアに由来する生物情報の絶え間ない変化により形作られ、数十億年の間にあらゆる種類の生物の表現型に発展したことは驚くべきことではない。
外部影響因子である神経系と筋肉・臓器の受け皿を割り当てる。 筋/臓器は、環境と相互作用し、異なる気候や生息地のために直面する環境上の課題に適応するために変化する動作単位として決定することができます。 神経系onthe other sideはoperationalunitsの適切な機能と調整を確保し、情報を処理し、operationalユニットを通じて外部信号への応答を与えるメタシステムの一種として決定することができる(Díaz、2017、6-9頁)
8.DNA evolution recording to Darwin andevolutionary science
Charles Darwin stand for the original concept ofevolution which applies the concept of “survival of the fittest”(「適合者存続」)。 これは、種の中で最も強く、最も適応した個体だけが、彼らが住むtheenvironmentを生き残ることができ、他の個体が環境に適応できないtotheirによって死ぬ一方で、彼らの遺伝子プール、または次の世代にbiologicalinformationを引き継ぐことができると言うものです。 今日の生物学者は、進化を「自己複製が可能な遺伝子を生み出せる個体の総和」(Lyre, 2002, p. 108)と判断している。 しかし、種においては、遺伝子プールにおけるランダムな突然変異と生殖の過程における組み換えにより、同じ遺伝情報を持つ「2つの個体」は存在しない。 このような個体の遺伝情報の変動は、カオス的なシステムで変動しており、いかなる計画や固定的なパターンによっても決定されることはない。 核酸塩基の配列、すなわちコドンの配列のランダムの偶然の一致が、生物情報の変化の原動力であると言える。 何世代にもわたる突然変異によって、最も適性で適応力のある個体は、この特殊な形質を持たない個体よりもよく生き残ることができるのである。 (Lyre, 2002, pp. 109-115)
9. 生物情報の進化
細胞構造の起源は偶然の産物であると言える。 何十億年も前の原始時代に、アミノ酸とヌクレオチドの列が漂っていたのである。 そして、ある種の偶然から、これらのひもは自分自身を組織化し始め、例えば環境や他の細胞から与えられた情報を処理し、それに応じて反応するネットワークを構築しました。 このネットワークは、外部から与えられた情報の全体的な処理を保証するために、円形になっている。 つまり、すべての生物学的生命体は、ある特定の生物学的情報の集合から進化し、したがって、偶然に発展した一つの原型から派生してきたということになる。 このことは、様々な種が受精した後の胚の発達段階にも見ることができる。 胚は初期段階では似ているが、時間とともにその種の特別な性質が発達し、形や能力で完全に区別されるようになるのだ
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