Viable Cell Counting
サンプルに含まれる菌の数は、さまざまな方法で数えることができます。 生細胞数は、サンプル中の活発に増殖/分裂している細胞の数を特定することができます。 プレートカウント法またはスプレッドプレートは、栄養培地上でコロニーを成長させる細菌に依存する。 コロニーは肉眼で見えるようになり、プレート上のコロニー数を数えることができる。 効果的な方法は、元の試料を希釈し、対象となる細菌のコロニーが平均30～300個生育するように調整することである。 30コロニーより少ないと統計的な根拠がなく、300コロニーを超えるとコロニーが重なり、カウントが不正確になることが多い。 適切な数のコロニーが得られるように、通常は数倍に希釈して培養する。 実験室では、試料を滅菌水で連続希釈（1：10、1：100、1：1000など）し、栄養寒天培地上で密閉培養する方法がとられている。 一般的な培地としては、一般細菌を数えるためのプレートカウント寒天培地や、大腸菌などのグラム陰性菌を数えるためのマッコンキー寒天培地などがある。 通常、1組のプレートは22℃、24時間、2組目は37℃、24時間インキュベートする。 栄養剤の組成は通常、非標的生物の増殖に抵抗し、標的生物を容易に識別できるようにする試薬を含み、しばしば培地の色の変化により識別することができる。 最近の方法では、コロニーのカウントを自動化するために蛍光剤を含むものもある。 コロニーは通常数ミリの大きさなので、顕微鏡は必要ない。
空気中で生育の悪い細菌種を探す場合は、pour plate法が用いられる。 最初の分析は、液体栄養寒天にサンプルの連続希釈液を混ぜ、それをビンに流し込むことによって行われる。 その後、ボトルを密閉して横にし、傾斜した寒天の表面を作る。 培養後、培地本体に発生したコロニーを目視で数えることができる。 コロニーの総数をTVC(Total Viable Count)と呼ぶ。 測定単位はcfu/ml（またはcolony forming units per milliliter）で、元の試料に関するものである。 計算方法は、カウントしたコロニー数に使用した希釈倍率をかけたものである。 生細胞数の測定には、液体培養の連続希釈によるスプレッドプレートや、プレートが使用される。 スプレッドプレートでは、液体培地を連続的に希釈し、希釈系列の最後のチューブから既知の量を散布する。 プレート上のコロニーを数え、元の培養物中のバクテリアの濃度を計算することができる。 プレート法では、希釈した細菌サンプルを溶かした寒天と混合し、その混合物をシャーレに流し込む。 この場合もコロニーを数え、生細胞数を算出する。