Cladosporium ear rotの最も効果的な管理方法の一つは、その存在をできるだけ早く確認し、トウモロコシが栽培・貯蔵される環境を管理することである。 2週間ごとに行うべき圃場のスカウトとマイコトキシン汚染の検査は、マイコトキシンがC. herbarumに特に関連していないものの、一般的に耳腐れが存在するかどうかを評価する最初のステップとなります。 問題のある圃場は、穀物の 10 ~ 20%に菌が付着している穂が 10%以上あることで特徴付けることができます。 感染した穂はできるだけ早く収穫し、菌の粒を取り除くために洗浄し、菌の成長を止めるためにすぐに水分 15% 以下まで乾燥させ、菌の無性生殖と拡散を止めるために水分 13-14% で 35~40°F の通風環境で保管する必要があります。 これらの文化的コントロールは収量損失を大きく減らすことができます。
C. herbarumは宿主に感染するために開口部を必要とするので、カーネルが傷つくのを防ぐ文化的コントロールは、新しい植物への感染を防ぐことになります。 殺虫剤を適時に使用して、穀粒を傷つけ、接種物が内部に入ることを可能にするコーンイヤーワームやヨーロピアンコーンボーラーを化学的に防除することができる。
また、作物の何パーセントが感染しているかを管理するあまり効果的でない方法は、抵抗性品種を植えて、最も影響を受けやすいものを廃棄することである。 しかし、すべての穂いもち菌に耐性のある雑種はなく、耐性品種も広く出回っていないため、Cladosporium ear rotiumに耐性があっても、他の穂いもち菌に感染する危険性があることは言及しておく必要があります。 また、籾殻がより多く覆われ、種皮が強固であれば、そもそも宿主に感染しづらくなります。 輪作は病原菌の除去に有効な文化的防除法であると思われますが、接種量に大きな影響を与えるため、郡内のすべてのコーン生産者が遵守する必要があります。 もしすべてのトウモロコシ生産者が輪作に同調していなければ、近くの畑の胞子が風に乗って他の畑に運ばれ、接種量レベルが妥当なレベルまで下がらないだけでしょう
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