湖や川、山は、地形に特定の目印がない自然境界です
湖や川では通常、境界は水体の真ん中を通っています。 ジュネーブ湖はフランスとの、ライン川はドイツとの、イン川はオーストリアとの境界を構成している。 例外はジュラ州のドゥブス川で、スイスの川岸が境界となり、サン＝ジンゴルフのモルジュ川はスイスの川岸の上端が境界となる。
これらの例外は歴史的なルーツを持ち、国境が定められた当時の参加国の力関係が反映されている。 ボーデン湖は特殊なケースで、スイス、ドイツ、オーストリアの水辺の3カ国は、法的な境界を定義したことがない。 3国の間には技術的な境界線だけが定義されている。 ボーデン湖は、国境を接する3カ国の主権の下にあるコンドミニアムと見なされている。 国境に関するすべての事柄は、これらの国の間の書面による協定によって処理されている
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