GO Terms Classifications Counter

CateGOrizer は、以前 “GO Terms Classifications Counter” として知られていた、GO用語データセットを、それらが表すGOクラスの観点から一括分析するための、改良されたフリーのウェブツールです。 Gene Ontology (GO) の有用な特徴の一つは、生物学の文脈の中で基本的な用語の階層と用語間の関係を記述するのに役立つことである。 通常、一連のGO用語がGOの遺伝子カテゴリーによってどのように表現されているかを明確に把握することは困難な作業である。 このウェブツールは、GOデータベースの推移的閉包に基づき事前に計算された用語の関係を利用し、GO-Slimのような所定の分類方法に対してGOクラスをグループ化および分類することにより、データベース推論のプロセスを簡素化するものである。 このツールは、GO用語DAGデータを格納するMySQL DBMSと結合した一連のPerl CGIプログラムによって構成されている。

	INTRODUCTION: Batch analysis of GO annotations for gene function groups is a useful part of high-throughput microarray or EST data analysis.This utility for users to find your GO terms within the each of pre-defined set of parent/ancestor GO terms.は、あらかじめ定義された各GOタームの出現回数を調べるためのものである。 GO_slim、GOA、EGAD、MGI_GO_slim、GO-ROOTなどのGO slimmethodsに対して、ユーザーが選択した分類方法で段階的に分類し、その結果をウェブ上で返す（時間がかかりすぎる場合は、結果のリンクをユーザーにメールで送信する）。 結果には、すべての最終的なカウントとパーセンテージをリストした表と円グラフが含まれます。
	USAGES: このツールは、次の 3 ステップに従って簡単に使用できます： Step 3:
	質問と回答： 本ツールの正しい使い方や関連質問については、こちらのFAQ（よくある質問）をご覧ください。 この FAQ に記載されていない質問がある場合は、遠慮なくお知らせください。また、問題点やツールの改善提案など、あらゆるフィードバックをお待ちしています。
	PUBLICATIONS: Zhi-Liang Hu, Jie Bao and James M. Reecy (2008) “CateGOrizer.The CateGOrizer.The CateGOrizer.The CateGOrizer: を、Web ベースのプログラムとして公開した。 オンライン・ジャーナル・オブ・バイオインフォマティクス。 9 (2):108-112. Google の引用です。 2020年までに244件 Zhi-Liang Hu, Jie Bao and James M. Reecy (2007). このような場合、「Gene Ontology (GO) Terms Classifications Counter」 を利用することができます。 また、このような場合、「Gene Ontology (GO) Terms Classifications Counter」を利用することができます。