小児の尿路感染症（UTI）の65％から90％は大腸菌が原因であることが分かっています。 その他の病原体としては、Klebsiella属、Proteus属、Pseudomonas aeruginosa、Enterococcus属などがあります。 イスラエルの研究者（Nir Marcus and colleagues. The Paediatric Infectious Disease Journal 2005;24:581-5) は、大腸菌感染症と非大腸菌感染症を比較している。
2001年と2002年に、ある三次小児医療センターで158人の子どもが175回の培養証明付きの市中肺炎を経験した。 培養のための尿サンプルのほとんどは、カテーテル挿入（110件）または恥骨上吸引（41件）で採取された。 平均年齢は31か月で，新生児が50例，1か月以上の乳児が59例であった． 98例は女児であった． 70例は大腸菌以外の細菌が原因であった． 大腸菌以外の病原体は，Klebsiella属（22），緑膿菌（17），Enterococcus属（14），Proteus属（8），Enterobacter属（5），コアグラーゼ陰性ブドウ球菌（3）およびAcinobacter属（1）であった． 大腸菌感染症105例中37例，非大腸菌感染症70例中40例が男児であった。 大腸菌感染症10例と非大腸菌感染症21例は，前月に抗生物質治療を受けた後であった． 23例は，過去にUTIを発症し，予防薬を投与された小児で発症した． このうち7例は大腸菌によるもので，16例は大腸菌以外の病原体によるものであった． 8例はβ-ラクタム系抗生物質による予防を受け，8例とも非大腸菌感染症であった． トリメトプリム・スルファメトキサゾールによる予防を受けた小児では，大腸菌感染の可能性は非大腸菌感染と変わらなかった． 腎臓の基礎疾患は，非大腸菌感染症に比べ有意に多く認められた（46/70 vs 47/105）． 非大腸菌感染症では，広範囲の抗生物質に対する耐性が有意に高く，非大腸菌感染症の19%（大腸菌感染症では2%）が不適切な抗生物質の静脈内投与で初期治療を受けていた．
非大腸菌性尿路感染症は本シリーズでは一般的で，男性性，最近の抗生物質治療，腎臓の基礎疾患と関連していた． 抗生物質耐性は大腸菌性尿路感染症よりも高頻度であった。