Patiënten beleven een hyperthyroïde periode wanneer de cellulaire bekleding van de colloïdruimten faalt, waardoor overvloedig colloïd in de circulatie komt, met nekpijn en koorts. Patiënten worden dan gewoonlijk hypothyroïd als de hypofyse de TSH-productie vermindert en de ten onrechte vrijgekomen colloïd wordt uitgeput, waarna ze weer euthyroïd worden. De symptomen zijn die van hyperthyreoïdie en hypothyreoïdie. Bovendien kunnen patiënten lijden aan pijnlijke dysfagie. Bij histologie komen multi-nucleaire reuscellen voor. In sommige gevallen kunnen schildklierantilichamen aanwezig zijn. De klinische presentatie tijdens de hyperthyroïdie fase kan lijken op die van Diffuse Toxische Goiter of de ziekte van Graves. In dergelijke gevallen kan een radionuclide schildklieropname en -scan nuttig zijn, aangezien subacute thyroiditis zal resulteren in een verminderde isotopenopname, terwijl de ziekte van Graves over het algemeen zal resulteren in een verhoogde opname. Het onderscheid tussen deze twee soorten ziekte is belangrijk, omdat de ziekte van Graves en Diffuse Toxische Goiter kunnen worden behandeld met radiojoodtherapie, maar subacute thyroiditis is meestal zelfbeperkt en wordt niet behandeld met radiojood.