Meren, rivieren en bergen zijn natuurlijke grenzen zonder specifieke markeringen in het terrein.
Meren en rivieren
In meren en rivieren loopt de grens meestal door het midden van het waterlichaam. Het Meer van Genève vormt de grens met Frankrijk, de Rijn met Duitsland, en de Inn met Oostenrijk. Uitzonderingen op deze regel zijn de Doubs in het kanton Jura, waar de grens wordt bepaald door de Zwitserse oever, en de Morge in St-Gingolph, waar de bovenrand van de Zwitserse oever de grens bepaalt.
Deze uitzonderingen hebben historische wortels en weerspiegelen de machtsverhoudingen van de deelnemende staten op het moment dat de grenzen werden vastgesteld. De grensdefinities aldaar zijn ook thans nog vastgelegd in internationale verdragen.
Het Bodenmeer is een bijzonder geval, omdat de drie oeverstaten Zwitserland, Duitsland en Oostenrijk nooit een wettelijke grens hebben vastgesteld. Er is alleen een technische grens tussen de drie staten vastgesteld. Het meer wordt beschouwd als een condominium dat onder de soevereiniteit valt van de drie landen die eraan grenzen. Alle aangelegenheden met betrekking tot de grens worden geregeld in schriftelijke overeenkomsten tussen deze landen.