De darmklieren in het colon worden vaak coloncrypts genoemd. Het epitheliale binnenoppervlak van de dikke darm wordt onderbroken door invaginaties, de coloncrypten. De coloncrypten hebben de vorm van microscopisch kleine dikwandige reageerbuisjes met een centraal gat in de lengte van het buisje (het lumen van de crypten). Hier worden vier weefselsecties getoond, twee (A en B) dwars door de lange assen van de crypten gesneden en twee (C en D) evenwijdig aan de lange assen.
In deze beelden zijn de cellen gekleurd om een bruin-oranje kleur te tonen als de cellen een mitochondriaal eiwit produceren dat cytochroom c oxidase subunit I (CCOI of COX-1) wordt genoemd. De kernen van de cellen (gelegen aan de buitenranden van de cellen die de wanden van de crypten bekleden) zijn blauwgrijs gekleurd met hematoxyline. Zoals te zien is in de panelen C en D, zijn de crypten ongeveer 75 tot ongeveer 110 cellen lang. De gemiddelde omtrek van de crypten bedraagt 23 cellen. Uit de beelden blijkt een gemiddelde van ongeveer 1725 tot 2530 cellen per coloncrypte. Een andere meting leverde een bereik op van 1500 tot 4900 cellen per coloncrypte. De cellen worden aan de basis van de crypt geproduceerd en migreren naar boven langs de as van de crypt alvorens dagen later in het lumen van de colon te worden uitgestoten. Er zijn 5 tot 6 stamcellen aan de basis van de crypten.
Zoals geschat op de afbeelding in paneel A, zijn er ongeveer 100 coloncrypten per vierkante millimeter van het colonepitheel. De lengte van de menselijke dikke darm is gemiddeld 160,5 cm (gemeten van de bodem van de blindedarm tot de colorectale junctie) met een bereik van 80 cm tot 313 cm. De gemiddelde binnenomtrek van het colon is 6,2 cm. Dus, het binnenoppervlak epitheliale gebied van de menselijke dikke darm heeft een oppervlakte, gemiddeld, van ongeveer 995 cm2, die 9.950.000 (bijna 10 miljoen) crypten omvat.
In de vier hier getoonde weefseldoorsneden, hebben veel van de darmklieren cellen met een mitochondriale DNA-mutatie in het CCOI-gen en lijken meestal wit, met hun belangrijkste kleur is de blauw-grijze kleuring van de kernen. Zoals te zien is in paneel B, blijkt een deel van de stamcellen van drie crypten een mutatie in CCOI te hebben, zodat 40% tot 50% van de cellen die uit die stamcellen ontstaan, een wit segment vormen in het dwarsdoorsnedegebied.
Over het geheel genomen is het percentage crypten met een tekort aan CCOI minder dan 1% vóór de leeftijd van 40 jaar, maar neemt daarna lineair toe met de leeftijd. Het percentage coloncrypten met een tekort aan CCOI bedraagt gemiddeld 18% bij vrouwen en 23% bij mannen tegen de leeftijd van 80-84 jaar.
Crypts van het colon kunnen zich voortplanten door splijting, zoals te zien is in paneel C, waar een crypt zich splitst om twee crypten te vormen, en in paneel B waar ten minste één crypt lijkt te splijten. De meeste crypten met een CCOI-deficiëntie bevinden zich in clusters van crypten (klonen van crypten) met twee of meer crypten met een CCOI-deficiëntie naast elkaar (zie paneel D).