De tweede groep, de tilapia, omvat in het meer van Malawi slechts zes soorten in twee geslachten: De roodborsttilapia (Coptodon rendalli), een wijdverspreide Afrikaanse soort, is de enige substraat paaiende cichlide in het meer. Deze grote cichlide voedt zich hoofdzakelijk met macrofyten. De overige zijn vijf mondbroedende soorten Oreochromis; vier chamboes van het subgenus Nyasalapia (O. karongae, O. lidole, O. saka en O. squamipinnis) die endemisch zijn voor het systeem van het Malawimeer, alsmede de nauw verwante O. shiranus, die ook in het Chilwa-meer wordt aangetroffen. De Oreochromis uit Malawi voeden zich hoofdzakelijk met fytoplankton, kunnen, afhankelijk van de soort, tot 26-42 cm lang worden en zijn meestal zwart of zilvergrijs met relatief onduidelijke donkere strepen. Mannelijke kambo’s hebben unieke genitale kwastjes tijdens het broeden, die helpen bij de bevruchting van de eieren op een manier die vergelijkbaar is met de eivlekken op de anale vin van haplochromines.
Niet-cichlidenEdit
De kampango (Bagrus meridionalis), een van de grootste meervallen, die tot 1,5 m lang kan worden
De overgrote meerderheid van de vissoorten in het meer zijn cichliden. Onder de inheemse niet-cichliden zijn verschillende soorten cypriniden (in de geslachten Barbus, Labeo en Opsaridium, en de Lake Malawi sardine Engraulicypris sardella), luchtademende meervallen (Bathyclarias en Clarias, en de kampango Bagrus meridionalis), mochokide meerval (Chiloglanis en Malawi pieper Synodontis njassae), Mastacembelus stekelaal, mormyriden (Marcusenius, Mormyrops en Petrocephalus), de Afrikaanse tetra Brycinus imberi, de poeciliide Aplocheilichthys johnstoni, de gevlekte killifish (Nothobranchius orthonotus), en de gevlekte aal (Anguilla nebulosa).
Op genusniveau zijn de meeste van deze soorten wijdverbreid in Afrika, maar Bathyclarias is volledig beperkt tot het meer.
Ongewervelde dierenEdit
WeekdierenEdit
Het Malawimeer herbergt 28 soorten zoetwaterslakken (waarvan 16 endemisch) en 9 tweekleppigen (2 endemisch, Aspatharia subreniformis en de unionid Nyassunio nyassaensis). De endemische zoetwaterslakken behoren alle tot de geslachten Bellamya, Bulinus, Gabbiella, Lanistes en Melanoides.
Lake Malawi herbergt in totaal vier slakkensoorten in het geslacht Bulinus, dat een bekende tussengastheer van bilharzia is. Bij een onderzoek in Monkey Bay in 1964 werden twee endemische slakkensoorten van het genus (B. nyassanus en B. succinoides) in het meer gevonden, en twee niet-endemische soorten (B. globosus en B. forskalli) in van het meer gescheiden lagunes. Deze laatste soorten zijn bekende tussengastheren van bilharzia, en larven van de parasiet werden aangetroffen in water waarin deze soorten voorkwamen, maar bij experimenten slaagde C. Wright van het British Museum of Natural History er niet in de twee in het meer endemische soorten met de parasieten te infecteren. De veldwerkers, die vele uren op en in het meer doorbrachten, vonden noch B. globosus noch B. forskalli in het meer zelf. Meer recentelijk is de ziekte een probleem geworden in het meer zelf, aangezien de endemische B. nyassanus een tussengastheer is geworden. Deze verandering, voor het eerst opgemerkt in het midden van de jaren tachtig, houdt mogelijk verband met een afname van slaketende cichliden (bijvoorbeeld Trematocranus placodon) als gevolg van overbevissing en/of een nieuwe stam van de bilharzia parasiet.
SchaaldierenEdit
In tegenstelling tot het Tanganyika-meer met zijn vele inheemse zoetwaterkrabben en garnalen, zijn er maar weinig van dergelijke soorten in het Malawi-meer. De Malawi blauwe krab, Potamonautes lirrangensis (syn. P. orbitospinus), is de enige krab in het meer en hij is niet endemisch. De atyide garnaal Caridina malawensis is endemisch voor het meer, maar is weinig bekend en wordt van oudsher verward met C. nilotica, die niet in het meer voorkomt. Zoöplanktonische pelagische soorten omvatten twee cladocerans (Diaphanosoma excisum en Bosmina longirostris), drie roeipootkreeftjes (Tropodiaptomus cunningtoni, Thermocyclops neglectus en Mesocyclops aequatorialis), en verscheidene ostracoden (waaronder zowel beschreven als onbeschreven soorten).
MeervliegenEdit
Zware zwermen meervliegen (Chaoborus edulis), die lijken op verre rookpluimen boven het water
Het Malawimeer is beroemd om de enorme zwermen kleine, ongevaarlijke meervliegen, Chaoborus edulis. Deze zwermen, die meestal ver boven het water verschijnen, kunnen worden aangezien voor rookpluimen en werden ook opgemerkt door David Livingstone toen hij het meer bezocht. De aquatische larven voeden zich met zoöplankton en brengen de dag door op de bodem en de nacht in de bovenste waterlagen. Wanneer ze zich verpoppen, drijven ze naar de oppervlakte en veranderen in volwassen vliegen. De volwassen vliegen zijn zeer kortlevend en de zwermen, die enkele honderden meters groot kunnen zijn en vaak een spiraalvorm hebben, maken deel uit van hun paringsgedrag. Ze leggen hun eieren aan het wateroppervlak en de volwassen vliegen sterven. De larven zijn een belangrijke voedselbron voor vissen, en de volwassen vliegen zijn belangrijk voor zowel vogels als de plaatselijke bevolking, die ze verzamelt om kungu-koeken/burgers van te maken, een plaatselijke delicatesse met een zeer hoog eiwitgehalte.