Karenia brevis (Davis) Hanson en Moestrup is een eencellige dinoflagellate protist die schadelijke algenbloei veroorzaakt die jaarlijks voorkomt in de Golf van Mexico. Deze “rode vloed” veroorzaakt uitgebreide sterfte onder zeedieren en ziekte bij de mens door de productie van zeer krachtige neurotoxines, de zogenaamde brevetoxines. Inzicht in de moleculaire mechanismen die de groei en persistentie van K. brevis beheersen is van cruciaal belang om het ontstaan van schadelijke algenbloei te begrijpen en is een eerste vereiste voor de ontwikkeling van controlestrategieën. Karenia soorten (en andere fucoxanthin-bevattende dinoflagellaten) nemen ook een kritische positie in onder de algen met betrekking tot de plastide (fotosynthetische organel) evolutie. Deze taxa hebben een opmerkelijke genomische overgang ondergaan van een voorouderlijke toestand waarin hun plastide genoom bestond uit een klein aantal (ca. 16) minicirkels met één gen (de resterende plastide genen zijn nucleair gecodeerd) naar een naar verluidt typisch plastide door tertiaire endosymbiose (waarbij een organisme een symbiotisch organisme opslokt dat reeds een ander organisme heeft opgeslokt, dat op zijn beurt weer een ander organisme heeft opgeslokt). Er zullen ook ontwerp-sequenties worden gegenereerd voor de plastide en mitochondriale genomen van K. brevis en zijn zuster Karlodinium micrum om inzicht te krijgen in plastide endosymbiose en organellaire genoverdracht.
CSP-projectdeelnemers: Debashish Bhattacharya (indiener, Univ. of Iowa) en Frances Van Dolah (Natl. Oceanic and Atmospheric Admin.)