Fiksacja to proces, w którym allel staje się stałym allelem w populacji. Istnieje wiele sposobów na utrwalenie się allelu, ale najczęściej dzieje się to w wyniku współdziałania wielu procesów. Dwie kluczowe siły napędowe utrwalania to selekcja naturalna i dryf genetyczny. Selekcja naturalna została zapoczątkowana przez Darwina i obejmuje wiele procesów, które prowadzą do różnicowania przeżycia organizmów ze względu na różnice genetyczne lub fenotypowe. Dryf genetyczny jest procesem, w którym częstotliwości alleli zmieniają się w obrębie populacji. Dobór naturalny i dryf genetyczny napędzają ewolucję do przodu, a poprzez ewolucję allele mogą stać się stałe.
Procesy doboru naturalnego, takie jak dobór płciowy, zbieżny, rozbieżny lub stabilizujący, torują drogę do utrwalenia alleli. Jednym ze sposobów, w jaki niektóre z tych procesów naturalnej selekcji powodują utrwalenie jest jeden określony genotyp lub fenotyp, który jest faworyzowany, co prowadzi do konwergencji zmienności, aż jeden allel zostanie utrwalony. Dobór naturalny może działać w drugą stronę, gdzie dwa allele stają się stałe przez dwa specyficzne genotypów lub fenotypów są faworyzowane, co prowadzi do dywergencji w populacji, aż populacje stają się tak odrębne, że są teraz dwa gatunki, z których każdy ma swój własny fixed allele.
Selektywne naciski mogą sprzyjać pewnych genotypów lub fenotypów. Powszechnie znanym tego przykładem jest proces powstawania oporności na antybiotyki w populacjach bakterii. Ponieważ antybiotyki są stosowane do zabijania bakterii, niewielka ich liczba z korzystnymi mutacjami może przetrwać i ponownie zasiedlić środowisko, które jest teraz wolne od konkurencji. Allele dla oporności na antybiotyki stają się wtedy stałymi allelami w ocalałych i przyszłych populacjach. Jest to przykład efektu wąskiego gardła. Wąskie gardło występuje wtedy, gdy populacja jest poddawana silnej presji selekcyjnej i tylko niektóre osobniki przeżywają. Te osobniki, które przeżyły, mają zmniejszoną liczbę alleli obecnych w ich populacji, niż były obecne w populacji początkowej, jednak te pozostałe allele są jedynymi, które pozostaną w przyszłych populacjach, zakładając brak mutacji lub migracji. Ten efekt wąskiego gardła można również zaobserwować w przypadku klęski żywiołowej, jak pokazano na powyższym przykładzie królika.
Podobny do efektu wąskiego gardła, efekt założyciela może również powodować utrwalenie alleli. Efekt założyciela występuje wtedy, gdy mała populacja założycielska zostaje przeniesiona na nowy obszar i rozprzestrzenia się na przyszłą populację. Można to zaobserwować na przykładzie populacji łosia Alces alces w Nowej Fundlandii w Kanadzie. Łosie nie są rodzime dla Nowej Fundlandii, a w latach 1878 i 1904 na wyspę wprowadzono sześć łosi. Te sześć łosi założycielskich rozmnożyło obecną populację szacowaną na 4000-6000 łosi. Miało to dramatyczny wpływ na potomstwo łosi założycieli i doprowadziło do wielkiego spadku zmienności genetycznej w populacji nowofundlandzkich łosi w porównaniu z populacją kontynentalną.
Inne procesy losowe, takie jak dryf genetyczny, mogą prowadzić do utrwalenia. Poprzez te procesy losowe, niektóre losowe osobniki lub allele są usuwane z populacji. Te losowe fluktuacje w obrębie częstotliwości alleli mogą prowadzić do utrwalenia lub utraty pewnych alleli w populacji. Po prawej stronie znajduje się obrazek, który przedstawia kolejne pokolenia; częstości alleli zmieniają się losowo w obrębie populacji. Im mniejsza wielkość populacji, tym szybciej nastąpi utrwalenie lub utrata alleli. Jednak wszystkie populacje są napędzane do utrwalania alleli i jest to nieuniknione; po prostu zajmuje to różną ilość czasu ze względu na wielkość populacji.
Kilka innych przyczyn utrwalania się alleli to chów wsobny, ponieważ zmniejsza on zmienność genetyczną populacji, a zatem zmniejsza efektywną wielkość populacji. Pozwala to dryfowi genetycznemu powodować fiksację szybciej niż przewidywano.
Isolacja może również powodować utrwalenie, ponieważ zapobiega napływowi nowych zmiennych alleli do populacji. Często można to zaobserwować w populacjach wyspiarskich, gdzie populacje mają ograniczony zestaw alleli. Jedyna zmienność, która może być dodana do tych populacji jest przez mutacje.
.