Printre studenții săi s-au numărat Thurgood Marshall, Oliver Hill și Spottiswood Robinson, care au jucat cu toții un rol important în răsturnarea segregării în justiție. Din 1935 până în 1939, Houston a fost consilier special pentru NAACP și a devenit arhitectul provocării juridice împotriva lui Jim Crow. El a considerat că cea mai slabă verigă din lanțul segregării era educația, deoarece școlile pentru negri și cele pentru albi erau indiscutabil inegale în fiecare stat sudic. În cazul Gaines v. Canada (1939), Houston a susținut în fața Curții Supreme a Statelor Unite că era neconstituțional ca Missouri să excludă negrii de la facultatea de drept a universității statului, în condițiile în care, în conformitate cu prevederea „separat, dar egal”, nu exista nicio instituție comparabilă pentru negri în cadrul statului. Curtea a fost de acord.
În mod metodic, Houston și-a aplicat convingerea că, dacă NAACP ar putea acumula suficiente victorii mai mici în instanțe, vor fi stabilite suficiente precedente pentru ca, în cele din urmă, Curtea să declare neconstituționale toate formele de segregare în educație. Eforturile lui Houston au fost fructificate abia după moartea sa, în 1950, odată cu decizia istorică în cazul Brown v. Board of Topeka Education (1954). Segregarea a fost interzisă în școlile publice și, în curând, avea să fie declarată neconstituțională în toate formele sale.
–Richard Wormser
.