Lungan utsätts för enorma mängder luft och potentiellt smittsamma agens, men allvarliga infektioner förekommer sällan, vilket är ett bevis på de extraordinära naturliga försvarsmekanismerna i luftvägarna. De vanligaste orsakerna till bakteriella lunginfektioner hos normala värdar är Streptococcus pneumoniae, Haemophilus species, Staphylococcus aureus och Mycobacterium tuberculosis. Hos skadade värdar är de bakteriella orsakerna till lunginflammation mycket bredare, inklusive arter som vanligtvis inte anses ha hög virulens hos människor. Infektion med någon av dessa ovanliga bakteriearter kräver att man söker efter ett immunsupprimerande tillstånd. Det normala försvaret i luftvägarna omfattar ospecifika fysiska faktorer (den ”mukociliära trappan”) och medfödda faktorer, inklusive defensiner, lysozym och fagocytiska celler (polymorfonukleära leukocyter, pulmonella alveolära makrofager och dendritiska celler). Det antibakteriella försvaret förstärks av opsoniner, inklusive de som är naturligt närvarande (surfaktant och komplementkomponenter) och inducerade immunglobuliner. Immunokompromisserande tillstånd, där bakteriella lunginfektioner ofta förekommer, inkluderar (men är inte begränsade till) hypogammaglobulinemi, kronisk granulomatös sjukdom och primär ciliär dyskinesi. Var och en av dessa tillstånd illustrerar den viktiga roll som den handikappade delen av det medfödda och adaptiva immunsystemet spelar för att upprätthålla steriliteten i de nedre luftvägarna.