ChIP-seq-tjänst
Kromatinimmunutfällning (ChIP), en klassisk experimentell metod för att studera interaktionen mellan protein och DNA, används i stor utsträckning inom relaterade områden som histonmodifiering och genuttryck som regleras av specifika transkriptionsfaktorer. I och med utvecklingen och mognaden av NGS-tekniken möjliggör ChIP-sekvensering (ChIP-seq), en integrering av kromatinimmunuttagsexperiment med sekvensering med högt genomflöde, effektiv och noggrann screening av proteinbindningsställen i hela genomet. Dessutom kan DNA-bindningsställen som är associerade med specialiserade proteiner jämföras i olika celltyper och vävnader på grund av att de levande cellerna har sitt ursprung i protein-DNA-komplex.
Intro till ChIP-sekvensering
ChIP-seq, precis som RNA-seq, låter mystiskt och komplicerat, men det är det inte. Här är en lättsam introduktion till ämnet som täcker grunderna bakom experimentet, hur data bearbetas och vilka saker du kan göra med dem.
Riktlinjer för prover
| Service | Provetyp | Minimal mängd | Minimal koncentration | Kvalitet |
|---|---|---|---|---|
| ChIP-seq | DNA | 10ng | 1 ng/µL | Fragmenterat till 100-300bp |
*Mätning av koncentration med Qubit rekommenderas starkt.
*Vänligen ange Bioanalyzer-resultat för ditt prov om det finns tillgängligt.
*Vänligen tillhandahålla det ChIP-deriverade DNA:t i nukleasfritt vatten. Om RNase upptäcks när DNA-chipet körs i vår Bioanalyzer 2100, kommer kostnaden för att rengöra kontaminering orsakad av RNase att debiteras.
Tjänstearbetsflöde
Analysis pipeline (general purpose)
.