Texterna i ”Mother” handlar om Lennons båda föräldrar, som båda övergav honom under hans barndom. Hans far, Alf, lämnade familjen när John var ett spädbarn. Hans mor, Julia, bodde inte tillsammans med sin son, även om de hade ett gott förhållande; hon blev påkörd och dödad i en bilolycka den 15 juli 1958 av en polis som inte var i tjänst vid namn Eric Clague, när Lennon var 17 år. Under en av sina sista konserter förklarade Lennon att låten inte bara handlade om hans föräldrar, utan snarare ”om 99 procent av föräldrarna, levande eller halvdöda”.
”Mother” öppnar albumet, och börjar med en begravningsklocka som slår långsamt, fyra gånger. Låten avslutas med att Lennon upprepar frasen ”Mama don’t go, daddy come home”, varje gång med ökad intensitet tills han skriker ut repliken när låten tonar ut.
Lennon inspirerades till att skriva låten efter att ha genomgått primalterapi med Arthur Janov, ursprungligen i hans hem i Tittenhurst Park och sedan på Primal Institute i Kalifornien, där han stannade i fyra månader. Lennon, som så småningom hånade Janov, beskrev inledningsvis terapin som ”något som var viktigare för mig än The Beatles”.
Och även om Lennon sade att ”Mother” var den låt som ”verkade fastna i mitt huvud”, tvivlade han på dess kommersiella attraktionskraft och han övervägde att ge ut ”Love” som singel istället. I november 1982 släpptes en remixad version av ”Love” som singel för att hjälpa till att marknadsföra LP:n The John Lennon Collection.
En tidig version av ”Mother” framförd på elgitarr av Lennon kan höras på boxen John Lennon Anthology.
En demoversion av låten fanns med i slutscenen och eftertexterna till den biografiska filmen om John Lennon från 2009, Nowhere Boy.