O pulmão é exposto a enormes quantidades de ar e a agentes potencialmente infecciosos, mas raramente ocorrem infecções graves, uma prova das extraordinárias defesas naturais do trato respiratório. As causas mais comuns de infecções pulmonares bacterianas em hospedeiros normais incluem Streptococcus pneumoniae, Haemophilus species, Staphylococcus aureus e Mycobacterium tuberculosis. Em hospedeiros comprometidos, as causas bacterianas da pneumonia são muito mais amplas, incluindo espécies geralmente não consideradas de alta virulência em humanos. Na verdade, a infecção por uma destas espécies bacterianas incomuns exige uma busca por uma condição imunocomprometida. As defesas normais do tracto respiratório incluem factores físicos não específicos (a “escada rolante mucociliar”) e factores inatos, incluindo defensinas, lisozima e células fagocitárias (leucócitos polimorfonucleares, macrófagos alveolares pulmonares e células dendríticas). As defesas antibacterianas são reforçadas pelas opsoninas, incluindo as intrinsecamente presentes (surfactantes e componentes complementares) e as imunoglobulinas induzidas. As condições imunocomprometidas, nas quais as infecções pulmonares bacterianas ocorrem frequentemente, incluem (mas não estão limitadas a) hipogamaglobulinaemia, doença granulomatosa crónica e discinesia ciliar primária. Cada uma destas condições ilustra o papel essencial do elemento incapacitado do sistema imunitário inato e adaptativo na manutenção da esterilidade do tracto respiratório inferior.